目的：初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的LncRNAs，为进一步研究lncRNAs在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础。方法：分别提取3例患者食管癌组织及配对癌旁组织的总RNA，体外逆转录制备并标记为双链cDNA(ds-cDNA)，与人类LncRNA表达谱芯片进行杂交，经扫描后，用Agilent GeneSpring GX v11.5.1软件进行分析运算，筛选出差异表达的LncRNAs。qRT-PCR分析LncRNA在食管癌细胞及组织中的表达情况。结果：按照倍数≥2.0、P≤0.05的标准，筛选出表达差异有统计学意义的LncRNAs共1019个，其中399个上调，620个下调。GO分析和通路分析结果显示这些LncRNAs调控的差异表达的mRNAs主要与细胞周期、细胞分化、蛋白酶的活动等有关。结合Gibb食管癌相关的LncRNA差异表达谱分析发现lncRNA-UCA1可能参与食管癌发生发展。qRT-PCR结果显示，与永生化食管上皮细胞及癌旁组织相比，食管癌细胞及食管癌组织中lncRNA-UCA1均表达下调。结论：共筛选出淮安食管鳞癌与癌旁组织中1019个差异表达LncRNAs，其中LncRNAs-UCA1可能成为食管癌早期发现和诊断的生物标志物。
作者：李夏君；杨淼；董自成；刘冉；尹立红；浦跃朴
来源：癌变·畸变·突变 2014 年 6期
