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目的:通过网络药理学和分子对接,探讨分析丹栀逍遥散治疗干眼和抑郁的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台搜索丹栀逍遥散,结合文献筛选,得到丹栀逍遥散的活性成分和靶点.在DrugBank、Thera-peutic Target Database(TTD)、Online MendelianInheritancein Man Database(OMIM)、Gene Cards数据库分别搜索干眼和抑郁,得到干眼和抑郁相关的疾病靶点,运用Cytoscape3.9软件构建"丹栀逍遥散-干眼-抑郁"网络;使用STRING数据库构建靶蛋白相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络;利用R语言对关键靶点进行Gene Ontology(GO)富集和Kyoto EncyclopediaofGenesand Genomes(KEGG)富集分析,研究其作用机制.利用PyMOL和Auto DockVina等软件对丹栀逍遥散活性成分和核心靶蛋白进行分子对接.结果:共收集到丹栀逍遥散药物有效成分3095个以及对应成分靶点2727个;干眼疾病靶点3020个;抑郁疾病靶点3663个;药物与干眼-抑郁的疾病共有靶点132个;最终得到PPI网络肿关键靶点14个,分别为:MYC、HIF1A、ESR1、EGFR、CDKN1A、TP53、FOS、STAT3、MAPK3、STAT1、MAPK14、AKT1、MAPK1、CASP3;GO富集分析得到共2467条,其中细胞组成(cellular-component,CC)75条、分子功能(molecularfunction,MF)178条和生物过程(biologic

作者:王紫艳;时健;姚小磊;彭清华

来源:中医药临床杂志 2023 年 35卷 4期

知识库介绍

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作者:
王紫艳;时健;姚小磊;彭清华
来源:
中医药临床杂志 2023 年 35卷 4期
标签:
丹栀逍遥散 干眼 抑郁 网络药理学 作用机制
目的:通过网络药理学和分子对接,探讨分析丹栀逍遥散治疗干眼和抑郁的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台搜索丹栀逍遥散,结合文献筛选,得到丹栀逍遥散的活性成分和靶点.在DrugBank、Thera-peutic Target Database(TTD)、Online MendelianInheritancein Man Database(OMIM)、Gene Cards数据库分别搜索干眼和抑郁,得到干眼和抑郁相关的疾病靶点,运用Cytoscape3.9软件构建"丹栀逍遥散-干眼-抑郁"网络;使用STRING数据库构建靶蛋白相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络;利用R语言对关键靶点进行Gene Ontology(GO)富集和Kyoto EncyclopediaofGenesand Genomes(KEGG)富集分析,研究其作用机制.利用PyMOL和Auto DockVina等软件对丹栀逍遥散活性成分和核心靶蛋白进行分子对接.结果:共收集到丹栀逍遥散药物有效成分3095个以及对应成分靶点2727个;干眼疾病靶点3020个;抑郁疾病靶点3663个;药物与干眼-抑郁的疾病共有靶点132个;最终得到PPI网络肿关键靶点14个,分别为:MYC、HIF1A、ESR1、EGFR、CDKN1A、TP53、FOS、STAT3、MAPK3、STAT1、MAPK14、AKT1、MAPK1、CASP3;GO富集分析得到共2467条,其中细胞组成(cellular-component,CC)75条、分子功能(molecularfunction,MF)178条和生物过程(biologic