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目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨附子汤治疗颈椎病潜在分子机制.方法:通过检索TCMSP数据库获得每味中药的化学活性成分及作用靶点,通过检索GeneCard、OMIM、DisGeNet等数据库获得颈椎病的相关治疗靶点;通过Venny平台获得核心作用靶点,再利用Metascape对核心作用靶点进行GO功能富集分析,利用KEGG Mapper进行KEGG通路分析,其次借助STRING数据库并结合Cytoscape软件构建附子汤治疗颈椎病的"药物-活性成分-疾病作用靶点"及作用靶点网络与蛋白互作关系.最后检索PDB及PubChem数据库获得小分子和蛋白质结构,利用Autodock Vina软件及PyMOL进行分子对接验证.结果:筛选出药物潜在活性成分 38 个,药物潜在作用靶点 109 个,潜在疾病治病靶点 976 个.其中主要的核心作用靶点是 16 个.GO功能富集分析获得 283 个条目,KEGG分析主要涉及NF-κB信号通路、TNF信号通路等 55 个通路.分子对接提示Fumarine、Stigmasterol、Fruti-none A、Beta-sitosterol等与PTGS1、PTGS2 靶点具有较强亲和力.结论:附子汤通过多通路作用于颈椎病,从而为临床指导附子汤治疗颈椎病提供了科学依据.

作者:于澜;杨少锋

来源:中医药临床杂志 2023 年 35卷 6期

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作者:
于澜;杨少锋
来源:
中医药临床杂志 2023 年 35卷 6期
标签:
附子汤 NF-κB信号通路 TNF信号通路 网络药理学 分子对接技术 Fuzi decoction NF-κB signaling pathway TNF signaling pathway Network pharmacology Molecular docking technology
目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨附子汤治疗颈椎病潜在分子机制.方法:通过检索TCMSP数据库获得每味中药的化学活性成分及作用靶点,通过检索GeneCard、OMIM、DisGeNet等数据库获得颈椎病的相关治疗靶点;通过Venny平台获得核心作用靶点,再利用Metascape对核心作用靶点进行GO功能富集分析,利用KEGG Mapper进行KEGG通路分析,其次借助STRING数据库并结合Cytoscape软件构建附子汤治疗颈椎病的"药物-活性成分-疾病作用靶点"及作用靶点网络与蛋白互作关系.最后检索PDB及PubChem数据库获得小分子和蛋白质结构,利用Autodock Vina软件及PyMOL进行分子对接验证.结果:筛选出药物潜在活性成分 38 个,药物潜在作用靶点 109 个,潜在疾病治病靶点 976 个.其中主要的核心作用靶点是 16 个.GO功能富集分析获得 283 个条目,KEGG分析主要涉及NF-κB信号通路、TNF信号通路等 55 个通路.分子对接提示Fumarine、Stigmasterol、Fruti-none A、Beta-sitosterol等与PTGS1、PTGS2 靶点具有较强亲和力.结论:附子汤通过多通路作用于颈椎病,从而为临床指导附子汤治疗颈椎病提供了科学依据.