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目的 构建桃红四物汤干预腰椎间盘突出症的"药物-靶基因-疾病"预测模型,探究桃红四物汤治疗腰椎间盘突出症的核心靶点及作用通路.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台收集桃红四物汤中有效的化学成分及靶点信息,运用UniProt蛋白质数据库实现基因靶点名称规范化;从GeneCards、疗效靶点数据库、人类孟德尔遗传在线、DRUGBANK数据库中查找腰椎间盘突出症的靶点.构建"成分-靶点-疾病"网络,并对蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络进行可视化分析,分析排名前20个靶点的生物过程、分子功能、细胞组成和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)中信号通路.结果 筛选出69个桃红四物汤的有效化学成分,235个潜在基因靶点,其中与腰椎间盘突出症共同的基因靶点有82个.PPI网络分析显示,肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、激活蛋白1(activator protein 1,JUN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)是桃红四物汤干预腰椎间盘突出症的核心靶点.基因本体论的富集分析结果显示,桃红四物汤干预腰椎间盘突出症的过程涉及对DN

作者:乔明珠;吕浩;江渟

来源:安徽中医药大学学报 2022 年 41卷 2期

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作者:
乔明珠;吕浩;江渟
来源:
安徽中医药大学学报 2022 年 41卷 2期
标签:
桃红四物汤;腰椎间盘突出症;靶点;信号通路
目的 构建桃红四物汤干预腰椎间盘突出症的"药物-靶基因-疾病"预测模型,探究桃红四物汤治疗腰椎间盘突出症的核心靶点及作用通路.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台收集桃红四物汤中有效的化学成分及靶点信息,运用UniProt蛋白质数据库实现基因靶点名称规范化;从GeneCards、疗效靶点数据库、人类孟德尔遗传在线、DRUGBANK数据库中查找腰椎间盘突出症的靶点.构建"成分-靶点-疾病"网络,并对蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络进行可视化分析,分析排名前20个靶点的生物过程、分子功能、细胞组成和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)中信号通路.结果 筛选出69个桃红四物汤的有效化学成分,235个潜在基因靶点,其中与腰椎间盘突出症共同的基因靶点有82个.PPI网络分析显示,肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、激活蛋白1(activator protein 1,JUN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)是桃红四物汤干预腰椎间盘突出症的核心靶点.基因本体论的富集分析结果显示,桃红四物汤干预腰椎间盘突出症的过程涉及对DN