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基于网络药理学, 通过国内外文献检索获取柿果中的化合物, 采用Swiss target prediction数据库对化合物进行潜在靶点垂钓以探讨柿果的药理功能定位及作用机制.以Cytoscape软件构建化合物-靶点网络, 靶点-疾病名称-疾病分类网络, 同时对靶点进行蛋白相互作用 (PPI) 网络构建, 采用DAVID数据库对靶点进行通路富集分析.本研究共收集到柿果中16个化合物, 可作用于68个靶点, 这些靶点主要作用于心血管疾病、神经精神性疾病等.PPI网络图包含84个节点, 226条边, 其中degree值排前10的关键蛋白分别为ERS1、PGS2、MMP2、TIMP1、MMP9、MMP1、AR、SLC6A3、PRKCB、CYP19A1.上述靶点可调节氮素代谢、血清素能突触以及TRP通道炎症介质的调节等信号通路.本研究为阐明柿果的药理功能定位及其作用机制研究提供了可靠的依据.

作者:刘方;段灿灿;李晓飞;晏仁义;张建永

来源:生物资源 2019 年 41卷 2期

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作者:
刘方;段灿灿;李晓飞;晏仁义;张建永
来源:
生物资源 2019 年 41卷 2期
标签:
柿果 网络药理学 蛋白相互作用 (PPI) 网络 富集分析 作用机制 persimmon fruit network pharmacology protein-protein interaction network (PPI) network enrichment analysis mechanism of action
基于网络药理学, 通过国内外文献检索获取柿果中的化合物, 采用Swiss target prediction数据库对化合物进行潜在靶点垂钓以探讨柿果的药理功能定位及作用机制.以Cytoscape软件构建化合物-靶点网络, 靶点-疾病名称-疾病分类网络, 同时对靶点进行蛋白相互作用 (PPI) 网络构建, 采用DAVID数据库对靶点进行通路富集分析.本研究共收集到柿果中16个化合物, 可作用于68个靶点, 这些靶点主要作用于心血管疾病、神经精神性疾病等.PPI网络图包含84个节点, 226条边, 其中degree值排前10的关键蛋白分别为ERS1、PGS2、MMP2、TIMP1、MMP9、MMP1、AR、SLC6A3、PRKCB、CYP19A1.上述靶点可调节氮素代谢、血清素能突触以及TRP通道炎症介质的调节等信号通路.本研究为阐明柿果的药理功能定位及其作用机制研究提供了可靠的依据.