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利用DNA中转录因子结合位点分布的序列比较方法对DNA序列进行聚类,并分析基因之间的联系.运用Matlab工具结合TRANSFAC数据库中的数据,对一组基因芯片共调控基因的上游序列进行比较和聚类,获得能够反映基因关系的树状聚类结果,从中确定出具有共同功能特征的基因,揭示了在大骨节病相关的诸多基因中,基因CIDEA、CYP4V2、RHBDD3、ENC1的调控区域有共同序列特征,表达模式和调控机理最为相似.这为更深层次的基因功能分析提供了依据.

作者:王冠;吴晓明;王爽;郭雄

来源:北京生物医学工程 2009 年 28卷 2期

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作者:
王冠;吴晓明;王爽;郭雄
来源:
北京生物医学工程 2009 年 28卷 2期
标签:
序列比较 转录因子结合位点 调控序列 TRANSFAC
利用DNA中转录因子结合位点分布的序列比较方法对DNA序列进行聚类,并分析基因之间的联系.运用Matlab工具结合TRANSFAC数据库中的数据,对一组基因芯片共调控基因的上游序列进行比较和聚类,获得能够反映基因关系的树状聚类结果,从中确定出具有共同功能特征的基因,揭示了在大骨节病相关的诸多基因中,基因CIDEA、CYP4V2、RHBDD3、ENC1的调控区域有共同序列特征,表达模式和调控机理最为相似.这为更深层次的基因功能分析提供了依据.