目的 利用MEGA5.05软件构建乳铁蛋白及与其相互作用蛋白的系统发育树,以进一步寻找与乳铁蛋白相互作用的蛋白质.方法 将乳铁蛋白序列及与其相互作用的蛋白质序列以FASTA格式载入MEGA5.05软件,进化树生成算法采用邻接法,校验次数为1000次,其他参数为缺省数值,生成系统进化树.结果 与乳铁蛋白相互作用的蛋白质和乳铁蛋白之间有一定的同源关系,与乳铁蛋白相互作用的蛋白质之间也有一定的同源关系.结论 通过MEGA5.05软件构建系统发育树,可以预测出乳铁蛋白与肌红蛋白、载脂蛋白D、谷氨酰胺合酶可能存在相互作用.
作者:马文丽;庞莉莉;钮冰;郑文岭;黄俊逸
来源:北京生物医学工程 2013 年 32卷 1期