目的 膜性肾病是造成成年人肾病综合征的最常见因素之一,约1/3的患者会发展为终末期肾病.近年来,虽然与膜性肾病有关的自身抗原陆续被鉴定出来,但是对于其发病机制还是知之甚少.本研究依托GEO数据库的GSE108113数据集,从中提取膜性肾病患者的转录组相关数据,并通过生物信息学分析寻找与膜性肾病密切相关的关键基因和相关信号通路.方法 首先通过R软件分析获取在正常人肾小球组织和膜性肾病患者肾小球组织之间差异表达的基因,最终获得36个上调差异表达基因和126个下调差异表达基因.然后对差异表达基因进行GO注释和KEGG通路分析,最后通过Cytoscape软件里的MCODE插件进行聚类分析筛选核心基因.结果 通过生物信息学分析后最终获得以CYP3A5、CYP4A11、CYP2B6为代表的13个核心基因在正常肾小球与膜性肾病肾小球中差异表达,并且这些差异表达基因显著富集在药物代谢和视黄醇代谢通路.结论 本研究揭示了与膜性肾病密切相关的13个关键基因和药物代谢等信号通路,为揭示膜性肾病的发病机制提供研究基础.
作者:高燕;李叶;段雪婷;王倩;张海松;李铭
来源:北京生物医学工程 2022 年 41卷 2期