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目的:探究小鼠颞叶癫痫慢性发作期蛋白质功能和信号通路的改变.方法:(1)制备小鼠卡英酸颞叶癫痫模型,行为学达到Racine分级4分判定为造模成功.28 d后,取对照组和实验组小鼠海马组织进行磷酸化蛋白组学实验;(2)选取检出密度大于106的数据进行统计分析;(3)利用GO(Gene Ontology)数据库、KEGG(KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes)数据库和STRING数据库对磷酸化蛋白组学数据进行统计分析;(4)结合文献对组学结果进行分析.结果:(1)质谱共检测出12 697个蛋白质磷酸化位点,其中159个位点变化差异具有统计学意义(P<0.05);(2)在蛋白质功能层面,磷酸化水平显著性变化的蛋白质的分子功能主要是结合(39.5%)和催化活性(35.7%),这些蛋白质参与细胞交流(20.8%)、初级代谢和含磷酸盐化合物代谢等生化过程;(3)在信号通路层面,这些蛋白质参与10条信号转导通路,包括谷氨酸能突触信号通路、Ras信号通路、长时程增强信号通路等;(4)在蛋白质相互作用层面,这些蛋白质形成以Grin1和Dlg3为核心,以Arhgef 2、Arhgap33和Tiam1为核心与以Spnb1/3/4、Add3和Ank2为核心的蛋白质相互作用网;(5)磷酸化蛋白组学数据显示,Grin1、Arhgef2、Arhgap33、Tiam1、Sptbn1/2/4和Ank2等磷酸化水平在癫痫慢性发作期显著升高.结论:磷酸化蛋白组

作者:孙智明;陈倩;李明华;马维宁;赵旭阳;黄卓

来源:北京大学学报(医学版) 2019 年 51卷 2期

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作者:
孙智明;陈倩;李明华;马维宁;赵旭阳;黄卓
来源:
北京大学学报(医学版) 2019 年 51卷 2期
标签:
磷酸化蛋白组学 颞叶癫痫 癫痫发生
目的:探究小鼠颞叶癫痫慢性发作期蛋白质功能和信号通路的改变.方法:(1)制备小鼠卡英酸颞叶癫痫模型,行为学达到Racine分级4分判定为造模成功.28 d后,取对照组和实验组小鼠海马组织进行磷酸化蛋白组学实验;(2)选取检出密度大于106的数据进行统计分析;(3)利用GO(Gene Ontology)数据库、KEGG(KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes)数据库和STRING数据库对磷酸化蛋白组学数据进行统计分析;(4)结合文献对组学结果进行分析.结果:(1)质谱共检测出12 697个蛋白质磷酸化位点,其中159个位点变化差异具有统计学意义(P<0.05);(2)在蛋白质功能层面,磷酸化水平显著性变化的蛋白质的分子功能主要是结合(39.5%)和催化活性(35.7%),这些蛋白质参与细胞交流(20.8%)、初级代谢和含磷酸盐化合物代谢等生化过程;(3)在信号通路层面,这些蛋白质参与10条信号转导通路,包括谷氨酸能突触信号通路、Ras信号通路、长时程增强信号通路等;(4)在蛋白质相互作用层面,这些蛋白质形成以Grin1和Dlg3为核心,以Arhgef 2、Arhgap33和Tiam1为核心与以Spnb1/3/4、Add3和Ank2为核心的蛋白质相互作用网;(5)磷酸化蛋白组学数据显示,Grin1、Arhgef2、Arhgap33、Tiam1、Sptbn1/2/4和Ank2等磷酸化水平在癫痫慢性发作期显著升高.结论:磷酸化蛋白组