目的 筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能.方法 使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因.生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱.RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达.结果 筛选出差异表达基因FAM83A.发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大.预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序.二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲.RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达.结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点.
作者：刘镭；黄亮；车清海；赵恩宏；黄旭；程露阳；肖丽君
来源：重庆医学 2013 年 42卷 3期
