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目的:对2012年贵州省流行的风疹病毒进行鉴定,确定其基因型,并进行基因特征分析。方法采集2012年贵州省风疹爆发和散发疑似病例咽拭子标本,使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离。经RT-PCR方法鉴定为阳性的风疹病毒分离株,使用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因944个核苷酸片段,并对扩增产物进行序列测定和分析,与W HO 13个基因型的32个参考风疹病毒株的序列基于1E基因的739个核苷酸片段构建基因亲缘性关系树。结果贵州省首次成功分离到5株风疹病毒株,基因亲缘性关系树显示,该5株风疹病毒分离株均属1E基因型。5株风疹病毒分离株之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%~100.0%和100.0%;与WHO 1E基因型参考株中国株(T14-CH-02)核苷酸和氨基酸同源性分别为98.7%~98.9%和100.0%;与WHO 1E基因型参考株马来西亚株(M1-MAL-01)核苷酸和氨基酸同源性分别为97.5%~97.6%和99.5%。结论2012年贵州省分离的风疹病毒是1E基因型,与目前我国其他省份流行的风疹病毒基因型一致。本研究为贵州省积累了风疹病毒分子流行病学基线数据。

作者:唐小敏;朱贞;任刚;朱青;张丽;叶绪芳

来源:重庆医学 2013 年 32期

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作者:
唐小敏;朱贞;任刚;朱青;张丽;叶绪芳
来源:
重庆医学 2013 年 32期
标签:
风疹病毒 序列分析 1E基因型 rubella virus sequence analysis genotype 1E
目的:对2012年贵州省流行的风疹病毒进行鉴定,确定其基因型,并进行基因特征分析。方法采集2012年贵州省风疹爆发和散发疑似病例咽拭子标本,使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离。经RT-PCR方法鉴定为阳性的风疹病毒分离株,使用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因944个核苷酸片段,并对扩增产物进行序列测定和分析,与W HO 13个基因型的32个参考风疹病毒株的序列基于1E基因的739个核苷酸片段构建基因亲缘性关系树。结果贵州省首次成功分离到5株风疹病毒株,基因亲缘性关系树显示,该5株风疹病毒分离株均属1E基因型。5株风疹病毒分离株之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%~100.0%和100.0%;与WHO 1E基因型参考株中国株(T14-CH-02)核苷酸和氨基酸同源性分别为98.7%~98.9%和100.0%;与WHO 1E基因型参考株马来西亚株(M1-MAL-01)核苷酸和氨基酸同源性分别为97.5%~97.6%和99.5%。结论2012年贵州省分离的风疹病毒是1E基因型,与目前我国其他省份流行的风疹病毒基因型一致。本研究为贵州省积累了风疹病毒分子流行病学基线数据。