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目的 以网络药理学方法为基础分析淫羊藿与附子治疗膝骨关节炎(KOA)的潜在作用机制.方法 采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取药物的活性成分及其潜在靶点,根据药物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)属性对药物活性成分进行筛选,并结合相关文献进行补充;通过PubChem数据库检索活性成分的SMILES结构式和2D结构,经ADME筛选后将符合标准的化学成分传入Swiss Target Prediction数据库预测药物作用靶点;选用关键词"knee osteoarthritis"或"osteoarthritis of knee"在Genecards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、Drugbank数据库检索与KOA相关的主要靶点;绘制韦恩图,获取淫羊藿-附子与KOA的交集靶点;基于STRING数据库构建药物与疾病共同靶点的蛋白互作(PPI)网络;利用Cytoscape3.6.2软件构建"药物-活性成分-靶点"网络及PPI网络中关键靶点信息图.利用Metascape平台对药物与疾病交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 通过TCMSP检索及文献补充共获取药物活性成分33个,主要为槲皮素、山奈酚、木犀草素、淫羊藿苷、乌头碱、次乌头碱、中乌头碱等,药对相关靶点224个;作用于KOA的潜在治疗靶点74个,关键靶点有白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶-9(MM

作者:侯佳瑶;张亚奇;王小钢;邢光艳;赵子义

来源:重庆医学 2023 年 52卷 9期

知识库介绍

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作者:
侯佳瑶;张亚奇;王小钢;邢光艳;赵子义
来源:
重庆医学 2023 年 52卷 9期
标签:
淫羊藿 附子 信号通路 膝骨关节炎 网络药理学
目的 以网络药理学方法为基础分析淫羊藿与附子治疗膝骨关节炎(KOA)的潜在作用机制.方法 采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取药物的活性成分及其潜在靶点,根据药物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)属性对药物活性成分进行筛选,并结合相关文献进行补充;通过PubChem数据库检索活性成分的SMILES结构式和2D结构,经ADME筛选后将符合标准的化学成分传入Swiss Target Prediction数据库预测药物作用靶点;选用关键词"knee osteoarthritis"或"osteoarthritis of knee"在Genecards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、Drugbank数据库检索与KOA相关的主要靶点;绘制韦恩图,获取淫羊藿-附子与KOA的交集靶点;基于STRING数据库构建药物与疾病共同靶点的蛋白互作(PPI)网络;利用Cytoscape3.6.2软件构建"药物-活性成分-靶点"网络及PPI网络中关键靶点信息图.利用Metascape平台对药物与疾病交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 通过TCMSP检索及文献补充共获取药物活性成分33个,主要为槲皮素、山奈酚、木犀草素、淫羊藿苷、乌头碱、次乌头碱、中乌头碱等,药对相关靶点224个;作用于KOA的潜在治疗靶点74个,关键靶点有白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶-9(MM