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目的:在网络药理学理论基础上,对中药桑椹治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的作用机制进行研究分析.方法:检索TCMSP数据库,获取并汇总中药靶药桑椹的有效成分和作用部位;使用GeneCards、OMIM等数据库筛选PCOS的疾病相关作用位点;运用Venny 2.1.0软件和R软件,完成疾病与中药之间具有共同交集靶点的筛选,结合Cytoscape 3.8.2软件与STRING数据库完成中药桑椹与疾病PCOS可视化处理以及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图的构建;通过结合R软件及Bioconductor网站的运用,完成对中心靶点的基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用AutoDock Vina软件进行分子对接验证.结果:共得到桑椹单药的6个活性成分及其相关的166个作用靶点,与PCOS相关的基因有5470个,桑椹-PCOS的常见交集靶点有107个.GO分析结果表明显著富集在DNA结合转录因子等生物学过程.KEGG通路主要涉及脂质、动脉粥样硬化等.结论:本研究为桑椹单药治疗PCOS疗效筛选的进一步研究提供了基础与参考.

作者:彭韵嘉;陈甄;曾辉霞;管洁;吴龙杰;王茜;杨硕

来源:湖南中医杂志 2023 年 39卷 9期

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作者:
彭韵嘉;陈甄;曾辉霞;管洁;吴龙杰;王茜;杨硕
来源:
湖南中医杂志 2023 年 39卷 9期
标签:
多囊卵巢综合征 桑椹 网络药理学 作用机制 polycystic ovary syndrome mulberry network pharmacology mechanism of action
目的:在网络药理学理论基础上,对中药桑椹治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的作用机制进行研究分析.方法:检索TCMSP数据库,获取并汇总中药靶药桑椹的有效成分和作用部位;使用GeneCards、OMIM等数据库筛选PCOS的疾病相关作用位点;运用Venny 2.1.0软件和R软件,完成疾病与中药之间具有共同交集靶点的筛选,结合Cytoscape 3.8.2软件与STRING数据库完成中药桑椹与疾病PCOS可视化处理以及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图的构建;通过结合R软件及Bioconductor网站的运用,完成对中心靶点的基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用AutoDock Vina软件进行分子对接验证.结果:共得到桑椹单药的6个活性成分及其相关的166个作用靶点,与PCOS相关的基因有5470个,桑椹-PCOS的常见交集靶点有107个.GO分析结果表明显著富集在DNA结合转录因子等生物学过程.KEGG通路主要涉及脂质、动脉粥样硬化等.结论:本研究为桑椹单药治疗PCOS疗效筛选的进一步研究提供了基础与参考.