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目的 分析棉鼠肺表面活性相关蛋白A(SP-A)的基因序列结构和生物信息学特点,观察棉鼠肺损伤模型中SP-A mRNA和蛋白的表达水平,初探SP-A表达规律与肺损伤的相关性.方法 将32只棉鼠随机均分为4组:3个实验组棉鼠分别腹腔注射2 mg/kg脂多糖(LPS)处理24、48和96 h,对照组腹腔注射等量生理盐水.建模后提取棉鼠肺组织总RNA,经RT-PCR扩增SPA基因,并对其进行生物信息学分析;组织切片观察LPS作用不同时期肺组织病理学变化;qRT-PCR分析SPA mRNA的表达水平;蛋白质印迹法检测SP-A蛋白表达.结果 棉鼠SPA基因编码区长744 bp,编码248个氨基酸,具有多个半胱氨酸保守位点、α螺旋结构和糖基化位点,与其他物种相比其核苷酸(75.4%~90.1%)和氨基酸(70.6%~87.1%)序列均具有较高的同源性.在LPS诱导肺损伤模型中发现,与对照组相比,实验组棉鼠肺组织病理学改变随LPS刺激时间延长而加重,具有时间依赖性;SP-A mRNA和蛋白的表达水平在LPS处理24 h后开始迅速增加,差异有统计学意义(P<0.001和P<0.01),48 h时仍持续上升(P<0.001和P<0.01),96 h时略有下降,但仍保持在较高水平,与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05和P<0.01).结论 棉鼠SPA基因具有高度保守性;棉鼠SP-A mRNA和蛋白的表达水平与肺损伤严重程度密切相关,可反应肺损

作者:杨守;冯怡;赵丽;黄轶;黄道超

来源:第二军医大学学报 2016 年 37卷 12期

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作者:
杨守;冯怡;赵丽;黄轶;黄道超
来源:
第二军医大学学报 2016 年 37卷 12期
标签:
棉鼠亚科 肺表面活性物质相关蛋白质A 肺损伤 计算生物学 sigmodontinea pulmonary surfactant-associated protein A lung injury computational biology
目的 分析棉鼠肺表面活性相关蛋白A(SP-A)的基因序列结构和生物信息学特点,观察棉鼠肺损伤模型中SP-A mRNA和蛋白的表达水平,初探SP-A表达规律与肺损伤的相关性.方法 将32只棉鼠随机均分为4组:3个实验组棉鼠分别腹腔注射2 mg/kg脂多糖(LPS)处理24、48和96 h,对照组腹腔注射等量生理盐水.建模后提取棉鼠肺组织总RNA,经RT-PCR扩增SPA基因,并对其进行生物信息学分析;组织切片观察LPS作用不同时期肺组织病理学变化;qRT-PCR分析SPA mRNA的表达水平;蛋白质印迹法检测SP-A蛋白表达.结果 棉鼠SPA基因编码区长744 bp,编码248个氨基酸,具有多个半胱氨酸保守位点、α螺旋结构和糖基化位点,与其他物种相比其核苷酸(75.4%~90.1%)和氨基酸(70.6%~87.1%)序列均具有较高的同源性.在LPS诱导肺损伤模型中发现,与对照组相比,实验组棉鼠肺组织病理学改变随LPS刺激时间延长而加重,具有时间依赖性;SP-A mRNA和蛋白的表达水平在LPS处理24 h后开始迅速增加,差异有统计学意义(P<0.001和P<0.01),48 h时仍持续上升(P<0.001和P<0.01),96 h时略有下降,但仍保持在较高水平,与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05和P<0.01).结论 棉鼠SPA基因具有高度保守性;棉鼠SP-A mRNA和蛋白的表达水平与肺损伤严重程度密切相关,可反应肺损