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目的 利用全基因组寡核苷酸芯片检测干扰素调节因子-4结合蛋白(IRF-4 binding protein,IBP)表达抑制后活化T淋巴细胞基因表达谱的差异.方法 采用本室构建的IBP表达抑制的Jurkat T细胞及相应对照细胞为实验对象,Anti-CD3、CD28 mAb处理细胞后提取刺激24、48 h的细胞总RNA,利用北京博奥生物有限公司22K Human Genome Array芯片检测基因表达的差异,以MAS.doc.V1软件,结合KEGG、NCBI等生物信息学数据库检索分析差异表达基因功能和网络关系.结果 IBP基因表达抑制的Jurkat T细胞在TCR信号刺激24、48 h后,细胞能量代谢、周期生长、转录调控及凋亡等多种类型的基因发生差异表达改变,2个时相组共有56个差异表达趋势一致基因,其中17个基因共同上调,39个基因共同下调.结论 在活化的Jurkat T细胞中IBP表达抑制所致多个基因差异表达.

作者:向莉;李鹏;张竹君;杨明珍;陈安;胡川闽

来源:第三军医大学学报 2013 年 35卷 2期

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作者:
向莉;李鹏;张竹君;杨明珍;陈安;胡川闽
来源:
第三军医大学学报 2013 年 35卷 2期
标签:
干扰素调节因子-4结合蛋白 T淋巴细胞 基因芯片
目的 利用全基因组寡核苷酸芯片检测干扰素调节因子-4结合蛋白(IRF-4 binding protein,IBP)表达抑制后活化T淋巴细胞基因表达谱的差异.方法 采用本室构建的IBP表达抑制的Jurkat T细胞及相应对照细胞为实验对象,Anti-CD3、CD28 mAb处理细胞后提取刺激24、48 h的细胞总RNA,利用北京博奥生物有限公司22K Human Genome Array芯片检测基因表达的差异,以MAS.doc.V1软件,结合KEGG、NCBI等生物信息学数据库检索分析差异表达基因功能和网络关系.结果 IBP基因表达抑制的Jurkat T细胞在TCR信号刺激24、48 h后,细胞能量代谢、周期生长、转录调控及凋亡等多种类型的基因发生差异表达改变,2个时相组共有56个差异表达趋势一致基因,其中17个基因共同上调,39个基因共同下调.结论 在活化的Jurkat T细胞中IBP表达抑制所致多个基因差异表达.