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目的 人结肠癌细胞SW480与酪酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)共培养后,检测SW480细胞lncRNAs和mRNAs的应答变化及诱导凋亡的机制.方法 1.5×107 CFU/mL酪酸梭菌处理结肠癌细胞48 h后,提取总RNA,对其逆转录RNA并作荧光标记,与安捷伦人lncRNAs/mRNAs芯片杂交.生物信息学预测表达差异的lncRNAs靶基因,并利用DAVID6.7对其进行信号通路富集度分析.双苯并咪唑Hoechst 33258(bisbenzimlde)和Annexin V-FITC/PI染色检测细胞凋亡.结果 与SW480对照组相比,共培养酪酸梭菌的结肠癌细胞SW480中的lncRNAs有50个表达上调和152个表达下调的基因,mRNAs中有738个表达上调和1 088个表达下调的基因.对差异表达的基因进行信号通路富集度分析,显示参与肿瘤相关的信号传导途径有MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子、JAK-STAT信号、NF-κB的激活、VEGF信号通路和p53信号通路.酪酸梭菌能显著促进结肠癌细胞凋亡.结论 酪酸梭菌通过调节lncRNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480凋亡.

作者:杨晓容;张德纯;杨金梅;李世超;刘胜男;郭亚楠

来源:第三军医大学学报 2015 年 37卷 21期

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作者:
杨晓容;张德纯;杨金梅;李世超;刘胜男;郭亚楠
来源:
第三军医大学学报 2015 年 37卷 21期
标签:
酪酸梭菌 结肠癌 SW480细胞 长链非编码RNA Clostridium butyricum colon cancer SW480 cells long non-coding RNA
目的 人结肠癌细胞SW480与酪酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)共培养后,检测SW480细胞lncRNAs和mRNAs的应答变化及诱导凋亡的机制.方法 1.5×107 CFU/mL酪酸梭菌处理结肠癌细胞48 h后,提取总RNA,对其逆转录RNA并作荧光标记,与安捷伦人lncRNAs/mRNAs芯片杂交.生物信息学预测表达差异的lncRNAs靶基因,并利用DAVID6.7对其进行信号通路富集度分析.双苯并咪唑Hoechst 33258(bisbenzimlde)和Annexin V-FITC/PI染色检测细胞凋亡.结果 与SW480对照组相比,共培养酪酸梭菌的结肠癌细胞SW480中的lncRNAs有50个表达上调和152个表达下调的基因,mRNAs中有738个表达上调和1 088个表达下调的基因.对差异表达的基因进行信号通路富集度分析,显示参与肿瘤相关的信号传导途径有MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子、JAK-STAT信号、NF-κB的激活、VEGF信号通路和p53信号通路.酪酸梭菌能显著促进结肠癌细胞凋亡.结论 酪酸梭菌通过调节lncRNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480凋亡.