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目的 建立口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)增殖相关基因(proliferation-associated differentially expressed genes,PADEGs)风险回归模型,评估患者预后情况.方法 从MSigDB数据库中收集了1 899个增殖相关基因,在TCGA数据库中下载OSCC患者基因表达及临床数据,将OSCC患者按照7:3的比例分到训练组和验证组,通过Wilcoxon秩和检验获得了癌和癌旁组织中表达有差异的PADEGs,通过单因素Cox分析、Lasso回归分析,构建增殖相关基因风险回归模型,并通过生存分析、独立预后分析评估该模型的准确性.将验证组OSCC患者数据代入模型进行验证.结果 筛选出了8个建模基因(APP、STC1、SFRP1、ABCB1、HPRT1、ZAP70、ST8SIA1、ADGRG1),构建了风险回归模型.具有高风险评分的OSCC患者预后较差(P<0.01),该增殖相关基因风险回归模型评分可作为OSCC患者独立预后因素(P<0.01).结论 成功建立了口腔鳞状细胞癌增殖相关基因风险回归模型,它可能在口腔鳞状细胞癌患者临床干预和管理中成为可靠的预后指标.

作者:郭俊峰;张纲;谭颖徽

来源:第三军医大学学报 2020 年 42卷 18期

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作者:
郭俊峰;张纲;谭颖徽
来源:
第三军医大学学报 2020 年 42卷 18期
标签:
口腔鳞状细胞癌 增殖 预后
目的 建立口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)增殖相关基因(proliferation-associated differentially expressed genes,PADEGs)风险回归模型,评估患者预后情况.方法 从MSigDB数据库中收集了1 899个增殖相关基因,在TCGA数据库中下载OSCC患者基因表达及临床数据,将OSCC患者按照7:3的比例分到训练组和验证组,通过Wilcoxon秩和检验获得了癌和癌旁组织中表达有差异的PADEGs,通过单因素Cox分析、Lasso回归分析,构建增殖相关基因风险回归模型,并通过生存分析、独立预后分析评估该模型的准确性.将验证组OSCC患者数据代入模型进行验证.结果 筛选出了8个建模基因(APP、STC1、SFRP1、ABCB1、HPRT1、ZAP70、ST8SIA1、ADGRG1),构建了风险回归模型.具有高风险评分的OSCC患者预后较差(P<0.01),该增殖相关基因风险回归模型评分可作为OSCC患者独立预后因素(P<0.01).结论 成功建立了口腔鳞状细胞癌增殖相关基因风险回归模型,它可能在口腔鳞状细胞癌患者临床干预和管理中成为可靠的预后指标.