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从斜带石斑鱼垂体提取总RNA,再取其50 ng合成SMART cDNA.从所构建的垂体SMART cDNA质粒文库中筛选到生长激素/催乳素基因家族的2个成员的全长cDNA片段:生长激素(GH)基因全长为938 bp,编码204个氨基酸;催乳素基因(PRL)全长为1 429 bp,编码212个氨基酸.采用计算机软件Mega 2和CLUSTAL W1.64b对9种鱼的生长激素/催乳素基因家族的3个成员(GH、PRL和生长催乳素SL)的氨基酸序列进行系统分析,构建NJ分支系统树,对于序列中的插入/缺失位点则采用Pairaise Deletion,1 000次自展(Bootstrap)分析计算各节点支持率.根据3个基因的氨基酸序列构建的系统树表明,石斑鱼与金头鲷、金鲈和牙鲆聚成一类,虹鳟与大马哈鱼聚成一类,鲫鱼与鲶鱼聚成一类,鳗鲡成另外一类.根据石斑鱼全长cDNA推断的氨基酸序列比较表明,SL相对GH和PRL有较高的保守性.石斑鱼的GH、PRL和SL的氨基酸同源性在24

作者:贾海波;周莉;石耀华;桂建芳

来源:动物学研究 2004 年 25卷 3期

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作者:
贾海波;周莉;石耀华;桂建芳
来源:
动物学研究 2004 年 25卷 3期
标签:
斜带石斑鱼 垂体 SMART cDNA 生长激素/催乳素基因 生长激素 催乳素
从斜带石斑鱼垂体提取总RNA,再取其50 ng合成SMART cDNA.从所构建的垂体SMART cDNA质粒文库中筛选到生长激素/催乳素基因家族的2个成员的全长cDNA片段:生长激素(GH)基因全长为938 bp,编码204个氨基酸;催乳素基因(PRL)全长为1 429 bp,编码212个氨基酸.采用计算机软件Mega 2和CLUSTAL W1.64b对9种鱼的生长激素/催乳素基因家族的3个成员(GH、PRL和生长催乳素SL)的氨基酸序列进行系统分析,构建NJ分支系统树,对于序列中的插入/缺失位点则采用Pairaise Deletion,1 000次自展(Bootstrap)分析计算各节点支持率.根据3个基因的氨基酸序列构建的系统树表明,石斑鱼与金头鲷、金鲈和牙鲆聚成一类,虹鳟与大马哈鱼聚成一类,鲫鱼与鲶鱼聚成一类,鳗鲡成另外一类.根据石斑鱼全长cDNA推断的氨基酸序列比较表明,SL相对GH和PRL有较高的保守性.石斑鱼的GH、PRL和SL的氨基酸同源性在24