目的应用基因芯片初步筛选大肠侧向发育型肿瘤(LST)相关基因,为进一步研究大肠癌的发病机制提供新的思路和线索.方法抽提大肠侧向发育型肿瘤癌细胞株、SW480细胞株、LoVo细胞株的总RNA并纯化mRNA;将18 816种人类基因及LST片段PCR产物用Biorobotics公司的BG600点样仪点样于纤维膜上,制成基因芯片.将3个样品的mRNA分别逆转录合成探针并33P标记,同芯片杂交.严格洗片后Fuji film公司FLA 3000扫描仪扫描芯片信号图象,ArrayGauge1.0软件分析比较3种细胞株中差异表达基因.结果和结论在18 816种人类基因中存在着一系列LST同普通大肠癌细胞株之间的差异表达基因.在本研究中共有差异表达基因97个,其中共上调58个,共下调39个.表明其可能存在不同的肿瘤发生机制,故进一步研究其相关基因,在分子水平上阐明其发生机制及与大肠癌的关系具有重要意义.
作者:王新颖;姜泊;赖卓胜;马文敏;耿焱
来源:第一军医大学学报 2004 年 24卷 9期