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目的 将焦磷酸测序技术应用于败血症常见病原体的检测鉴定.方法 根据细菌16S rRNA序列的特点,设计焦磷酸测序用的PCR扩增引物和测序引物,提取败血症常见病原体的基因组DNA,进行焦磷酸测序,分析获得的序列,进行比对,对病原体种类作出判断.结果 经焦磷酸测序可以获取有效长度28 bp的序列,使用该测序序列可以有效区分化脓性链球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷白杆菌、脑膜炎双球菌、沙门氏菌,但不能区分金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌.结论 应用焦磷酸测序可以较有效地对败血症常见病原体的种类实现种属水平的区分.

作者:胡子有;韩慧;曾勇;吴炳义

来源:南方医科大学学报 2013 年 33卷 7期

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作者:
胡子有;韩慧;曾勇;吴炳义
来源:
南方医科大学学报 2013 年 33卷 7期
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焦磷酸测序 败血症 病原体 16sRNA pyrosequencing sepsis pathogen 16S rRNA
目的 将焦磷酸测序技术应用于败血症常见病原体的检测鉴定.方法 根据细菌16S rRNA序列的特点,设计焦磷酸测序用的PCR扩增引物和测序引物,提取败血症常见病原体的基因组DNA,进行焦磷酸测序,分析获得的序列,进行比对,对病原体种类作出判断.结果 经焦磷酸测序可以获取有效长度28 bp的序列,使用该测序序列可以有效区分化脓性链球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷白杆菌、脑膜炎双球菌、沙门氏菌,但不能区分金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌.结论 应用焦磷酸测序可以较有效地对败血症常见病原体的种类实现种属水平的区分.