目的 旨在寻找与浸润性乳腺癌(BRCA)发生相关的肿瘤微环境(TME)相关基因,以预测其预后并为临床提供治疗靶点.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索到RNA转录组数据和临床相关数据.利用ESTIMATE算法计算基质评分和免疫评分.然后通过取交集筛选出差异表达基因(DEGs).利用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和单变量COX回归分析来确定DEGs中的核心基因.选取一个核心基因进行GSEA集富集分析和CIBERSORT分析,以分别区分核心基因表达的功能和肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的比例.最终用Western blot和qRT-PCR对CD40LG的表达水平进行临床验证.结果 从TCGA中提取了1222个样本(124个正常样本和1098个肿瘤样本)进行分析,共获得了487个DEG.这些基因主要富集在与免疫相关的途径中.进一步的交叉分析揭示了11个关键基因,包括CD40LG、ITK、CD5、CD3E、SPN、IL7R、CD48、CCL19、CD2、CD52和CD2711,这些基因被证明与乳腺癌TME状态相关.挑选了CD40LG进行进一步研究,结果表明,CD40LG高表达BRCA患者的总生存期(OS)比低表达BRCA患者更长(P=0.002),并且CD40LG表达在TNM分期、肿瘤大小方面的差异也具有统计学意义(P<0.05).GSEA和CIBERSORT分析表明CD40LG的表达与TME中的免疫活性有关.Western blot和qRT-PCR结果显示CD40LG在乳腺癌细胞

作者：郭丽；马银玲；李婷；李金平

来源：南方医科大学学报 2022 年 42卷 9期