目的 研究一个潜在的冷肿瘤微环境标志物——FARSB基因在泛癌中对肿瘤微环境以及患者对免疫治疗的反应的影响.方法 使用生物信息学方法研究FARSB在泛癌组织中的表达水平及突变情况.采用Kaplan-Meier和单因素Cox回归分析FARSB的预后意义.通过基因集富集和变异分析,研究受FARSB影响的信号转导途径.用TIMER2数据库和R软件包分析FARSB表达与免疫浸润的关系.分析队列GSE72056,GSE131907,GSE132465,GSE125449和PMID32561858的单细胞RNA测序数据,以验证FARSB对肿瘤微环境的影响.在3个接受免疫检查点抑制剂治疗的队列中(PMID32472114、GSE176307和Riaz2017)中,探讨FARSB对免疫治疗疗效的预测作用.结果 FARSB在25种肿瘤组织中的表达明显高于正常组织,并且几乎在所有肿瘤类型中都与不良预后有关.FARSB的表达与多种DNA损伤修复途径密切相关,与肺腺癌组织中基因TP53的突变显著相关(P<0.0001,OR=2.25).FARSB表征了典型的免疫沙漠型肿瘤微环境,且与趋化因子及趋化因子受体表达受抑制有关.大规模的单细胞RNA测序分析证实了FARSB的免疫抑制作用,并揭示了FARSB通过阻碍细胞间相互作用而潜在地塑造冷肿瘤微环境.在3个接受免疫检查点抑制剂治疗的队列中,FARSB对免疫治疗效果显示出良好的预测价值.结论 本研究通过整合单细胞
作者：张自然；谭家乐；于子航；刘承栋；王剑；吴德华；白雪
来源：南方医科大学学报 2023 年 43卷 5期
