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背景与目的:比较基因组杂交和微卫星多态性位点全基因组扫描结果显示肺癌患者在染色体 3p、 5q、 6q、 9p、 10q、 11p、 13q、 17p、 19p等区域存在高频率的杂合性缺失,提示可能有多个未知的易感基因或抑癌基因与肺癌的发生、发展相关.本研究选用在 mRNA差异显示研究中获得的在肺癌组织中表达下调且代表新基因的表达序列标签 (expressed sequence tag,EST)LXDD1为进一步研究对象,克隆其全长 cDNA.方法:采用 Northern杂交验证 LXDD1在肺癌中的表达差异 ,并用 MTN( Multiple Tissue Northern BlotsTM)膜检测其在正常组织中的表达及其所代表基因的转录本大小;克隆其全长 cDNA,并利用生物信息学对该序列进行初步分析;用差异 RT-PCR检测新基因在肺癌组织、配对癌旁非癌组织、肺癌细胞系和其它肿瘤细胞系中的表达.结果:成功地克隆了一个在肺癌中表达下调的新基因 HLCDG1(human lung carcinoma deleted gene 1), GenBank登录号为 AF447582,全长 cDNA为 3.113 kb,预测其开放阅读框编码一个含 166个氨基酸的跨膜蛋白质 ,通过电子-聚合酶链反应( electric-polymerase chain reaction,e-PCR)将该基因定位于 5q33.结论: HLCDG1基因是一个在肺癌中表达下调的新基因,这提示 HLCDG1可能与肺癌的发生、发展相关.

作者:谢海龙;陈主初;何春梅;李友军;邹飞雁;关勇军

来源:癌症 2003 年 22卷 10期

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作者:
谢海龙;陈主初;何春梅;李友军;邹飞雁;关勇军
来源:
癌症 2003 年 22卷 10期
标签:
肺肿瘤 基因克隆 基因表达
背景与目的:比较基因组杂交和微卫星多态性位点全基因组扫描结果显示肺癌患者在染色体 3p、 5q、 6q、 9p、 10q、 11p、 13q、 17p、 19p等区域存在高频率的杂合性缺失,提示可能有多个未知的易感基因或抑癌基因与肺癌的发生、发展相关.本研究选用在 mRNA差异显示研究中获得的在肺癌组织中表达下调且代表新基因的表达序列标签 (expressed sequence tag,EST)LXDD1为进一步研究对象,克隆其全长 cDNA.方法:采用 Northern杂交验证 LXDD1在肺癌中的表达差异 ,并用 MTN( Multiple Tissue Northern BlotsTM)膜检测其在正常组织中的表达及其所代表基因的转录本大小;克隆其全长 cDNA,并利用生物信息学对该序列进行初步分析;用差异 RT-PCR检测新基因在肺癌组织、配对癌旁非癌组织、肺癌细胞系和其它肿瘤细胞系中的表达.结果:成功地克隆了一个在肺癌中表达下调的新基因 HLCDG1(human lung carcinoma deleted gene 1), GenBank登录号为 AF447582,全长 cDNA为 3.113 kb,预测其开放阅读框编码一个含 166个氨基酸的跨膜蛋白质 ,通过电子-聚合酶链反应( electric-polymerase chain reaction,e-PCR)将该基因定位于 5q33.结论: HLCDG1基因是一个在肺癌中表达下调的新基因,这提示 HLCDG1可能与肺癌的发生、发展相关.