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背景与目的:LRP16基因是新发现的白血病相关基因,其生物学功能还远未被阐明.本研究基于生物信息学分析探讨人类LRP16基因的生物学功能.方法:采用生物信息学方法分析LRP16基因启动子及编码蛋白的结构、功能,并对预测结果进行实验验证.建立pGL3-Basic重组载体,并进行荧光素酶活性分析.构建ORF-pcDNA3.1+真核表达载体,转染入HL-60、K562细胞后,采用单细胞凝胶电泳法检测HL-60细胞紫外线损伤,流式细胞术检测K562细胞周期.结果:LRP16基因启动子是一个典型的Ⅱ型真核肩动子,核心调控区位于-600 bp以内,具有7个与细胞周期、造血调控、细胞增殖及DNA损伤修复等有关的顺式作用元件.LRP16基因长型编码蛋白在148-315氨基酸残基之间具有与人类组蛋白H2AlC末端相类似的同源序列hismacro、COG2110和A1pp.紫外线照射HL-60细胞后,LRP16过表达组的彗星细胞数量、慧尾长度明显小于空质粒对照组,且活细胞数量明显多于空质粒对照组.过表达LRP16基因的K562细胞的增殖速度和G_2/M期、S期细胞均明显高于空质粒对照组,且提前达到平台期.结论:基于生物信息学方法分析表明LRP16基因具有促进白血病细胞增殖、调控细胞周期及抗紫外线的DNA损伤作用.

作者:杨波;卢学春;迟小华;韩为东;于力;楼方定

来源:癌症 2009 年 28卷 12期

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作者:
杨波;卢学春;迟小华;韩为东;于力;楼方定
来源:
癌症 2009 年 28卷 12期
标签:
LRP16基因 功能 生物信息学 LRP16 function bioinformatics
背景与目的:LRP16基因是新发现的白血病相关基因,其生物学功能还远未被阐明.本研究基于生物信息学分析探讨人类LRP16基因的生物学功能.方法:采用生物信息学方法分析LRP16基因启动子及编码蛋白的结构、功能,并对预测结果进行实验验证.建立pGL3-Basic重组载体,并进行荧光素酶活性分析.构建ORF-pcDNA3.1+真核表达载体,转染入HL-60、K562细胞后,采用单细胞凝胶电泳法检测HL-60细胞紫外线损伤,流式细胞术检测K562细胞周期.结果:LRP16基因启动子是一个典型的Ⅱ型真核肩动子,核心调控区位于-600 bp以内,具有7个与细胞周期、造血调控、细胞增殖及DNA损伤修复等有关的顺式作用元件.LRP16基因长型编码蛋白在148-315氨基酸残基之间具有与人类组蛋白H2AlC末端相类似的同源序列hismacro、COG2110和A1pp.紫外线照射HL-60细胞后,LRP16过表达组的彗星细胞数量、慧尾长度明显小于空质粒对照组,且活细胞数量明显多于空质粒对照组.过表达LRP16基因的K562细胞的增殖速度和G_2/M期、S期细胞均明显高于空质粒对照组,且提前达到平台期.结论:基于生物信息学方法分析表明LRP16基因具有促进白血病细胞增殖、调控细胞周期及抗紫外线的DNA损伤作用.