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目的:建立快速准确的高效毛细管电泳( HPCE )定量基因组 DNA 甲基化的方法。方法以含有十二烷基磺酸钠(SDS)的碳酸氢钠溶液作为背景电解质溶液,优化运行电压、柱温,对DNA组成单元脱氧核苷酸进行分离定量。结果5种脱氧核糖核苷和5种核糖核苷在10 min 内实现基线分离。脱氧胞苷(dC)的标准曲线为Y =172540.15X-6.19,相关系数(R)为0.999,线性范围从2×10-3 mol/L 到2×10-1 mol/L。5-甲基脱氧胞苷(5 mdC)的标准曲线为 Y =170271.74X-46.19,相关系数(R)为0.995,线性范围从1×10-4 mol/L 到2×10-2 mol/L。日内相对标准偏差(RSD%)<5%,日间相对标准偏差( RSD%)<9%。5 mdC 和 dC 的检测限均为1×10-5 mol/L。样品的甲基化程度以(5 mdC )含量占总脱氧胞苷(5 mdC + dC )的比率表示。应用本方法分析小牛胸腺 DNA 的甲基化水平,结果为6.18%,与本研究组所得液质联用(LC-MS/MS)的定量结果(6.77%)和文献报导中应用液相色谱-紫外检测器(HPLC-UV)的检测结果(6.26%)对比,一致性好。结论本研究建立的方法分析速度快,准确性高,稳定性好,灵敏度满足微量样本的检测需求,可以用于临床甲基化诊断。

作者:张敏;陈倩;张丽娟;权力

来源:分子诊断与治疗杂志 2014 年 6期

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作者:
张敏;陈倩;张丽娟;权力
来源:
分子诊断与治疗杂志 2014 年 6期
标签:
DNA甲基化 高效毛细管电泳 定量分析 DNA methylation High performance capillary electrophoresis Quantitative analysis
目的:建立快速准确的高效毛细管电泳( HPCE )定量基因组 DNA 甲基化的方法。方法以含有十二烷基磺酸钠(SDS)的碳酸氢钠溶液作为背景电解质溶液,优化运行电压、柱温,对DNA组成单元脱氧核苷酸进行分离定量。结果5种脱氧核糖核苷和5种核糖核苷在10 min 内实现基线分离。脱氧胞苷(dC)的标准曲线为Y =172540.15X-6.19,相关系数(R)为0.999,线性范围从2×10-3 mol/L 到2×10-1 mol/L。5-甲基脱氧胞苷(5 mdC)的标准曲线为 Y =170271.74X-46.19,相关系数(R)为0.995,线性范围从1×10-4 mol/L 到2×10-2 mol/L。日内相对标准偏差(RSD%)<5%,日间相对标准偏差( RSD%)<9%。5 mdC 和 dC 的检测限均为1×10-5 mol/L。样品的甲基化程度以(5 mdC )含量占总脱氧胞苷(5 mdC + dC )的比率表示。应用本方法分析小牛胸腺 DNA 的甲基化水平,结果为6.18%,与本研究组所得液质联用(LC-MS/MS)的定量结果(6.77%)和文献报导中应用液相色谱-紫外检测器(HPLC-UV)的检测结果(6.26%)对比,一致性好。结论本研究建立的方法分析速度快,准确性高,稳定性好,灵敏度满足微量样本的检测需求,可以用于临床甲基化诊断。