目的 筛选参与肝细胞癌(HCC,简称肝癌)肿瘤进展的代谢重编程相关基因,明确HCC组织标本中ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)表达情况,并纳入GEO数据,分析其与HCC临床病理指标的相关性及其在HCC生存预后中的作用.方法 下载TCGA数据库中的HCC表达数据,将50对癌组织与癌旁配对组织样本纳入差异表达基因分析,获得全基因表达谱列表;设置差异表达基因纳入标准,获得差异表达基因列表;通过GSEA、GO及KEGG三种富集方法筛选获得共同的HCC代谢重编程相关基因.采用qRT-PCR检测ACLY在临床组织标本中的表达情况.下载GSE14520数据集并将隶属GPL3921平台的221例生存数据完整的基因芯片表达数据和临床数据纳入研究,通过生存分析、Cox回归分析和临床相关性研究明确ACLY与HCC预后的关系.结果 通过基因富集分析筛选获得26个HCC代谢重编程相关基因.临床标本检测显示ACLY在癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.05).相关性分析表明ACLY表达与TNM分期、CLIP分期和AFP相关(P<0.05);生存分析显示ACLY的表达与HCC总体生存率相关(P<0.05),并与HCC无复发生存有相关性趋势(P=0.05).Cox回归分析表明ACLY的表达水平与HCC总体生存和术后无复发生存率相关(P<0.05).结论 本研究获得了26个HCC代谢重编程相关基因,其中ACLY的异常表达与HCC分期显著相关;ACLY
作者:周青青;李军建;郑亦胡;余正平;朱千东
来源:肝胆胰外科杂志 2021 年 33卷 8期