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目的 通过生物信息学分析LAMA3的表达对胰腺癌预后的诊断价值及其与肿瘤临床特征的相关性.方法 从TCGA和GEO数据库分别下载胰腺癌转录组及临床数据,R软件用于数据处理和分析.首先明确LAMA3的差异表达,继而Kaplan-Meier分析LAMA3的表达与胰腺癌总生存时间的关系,进而采用Cox回归分析LAMA3的表达与临床病理特征的相关性.最后利用GSEA预测分析LAMA3在胰腺癌中可能的分子机制.结果 差异表达分析提示LAMA3在胰腺癌中显著高表达(P<0.05);生存分析提示LAMA3高表达的患者总体生存期明显短于低表达患者;单因素及多因素Cox回归分析提示LAMA3可以作为胰腺癌的独立预后因子.GSEA通路富集分析表明:p53信号通路、细胞周期、DNA复制、剪接体、蛋白酶体及氧化磷酸化在LAMA3高表达表型中富集;细胞因子-细胞因子受体相互作用和细胞黏附分子在LAMA3低表达表型中富集.结论 LAMA3高表达是胰腺癌一个独立的不良预后因子,促进了胰腺癌的增殖、侵袭和转移.

作者:王维杰;赵森峰;曹家辉;李冰洁

来源:肝胆胰外科杂志 2021 年 33卷 9期

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作者:
王维杰;赵森峰;曹家辉;李冰洁
来源:
肝胆胰外科杂志 2021 年 33卷 9期
标签:
胰腺癌;LAMA3;生物信息学分析;肿瘤预后;TCGA数据库;GEO数据库;基因集富集分析;KEGG数据库
目的 通过生物信息学分析LAMA3的表达对胰腺癌预后的诊断价值及其与肿瘤临床特征的相关性.方法 从TCGA和GEO数据库分别下载胰腺癌转录组及临床数据,R软件用于数据处理和分析.首先明确LAMA3的差异表达,继而Kaplan-Meier分析LAMA3的表达与胰腺癌总生存时间的关系,进而采用Cox回归分析LAMA3的表达与临床病理特征的相关性.最后利用GSEA预测分析LAMA3在胰腺癌中可能的分子机制.结果 差异表达分析提示LAMA3在胰腺癌中显著高表达(P<0.05);生存分析提示LAMA3高表达的患者总体生存期明显短于低表达患者;单因素及多因素Cox回归分析提示LAMA3可以作为胰腺癌的独立预后因子.GSEA通路富集分析表明:p53信号通路、细胞周期、DNA复制、剪接体、蛋白酶体及氧化磷酸化在LAMA3高表达表型中富集;细胞因子-细胞因子受体相互作用和细胞黏附分子在LAMA3低表达表型中富集.结论 LAMA3高表达是胰腺癌一个独立的不良预后因子,促进了胰腺癌的增殖、侵袭和转移.