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目的 应用微阵列芯片技术检测长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)组织中的表达谱,筛选OSCC发病过程中节点lncRNA,研究其表达和临床意义.方法 利用lncRNA表达谱芯片,对3例OSCC及对应正常组织的转录本进行高通量筛查,确定OSCC中的lncRNAs和mRNAs差异表达谱.利用lncRNA与mRNA特异性表达的标准化信号强度,构建差异基因共表达网络,挖掘节点基因,分析其表达水平与临床病理特征及患者预后之间的关系.选取部分差异表达的lncRNA,借助qRT-PCR技术对芯片结果进行验证.结果 实验共筛选出差异表达lncRNAs2 294条和mRNAs 1 938条.LncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10∶1是共表达网络的节点基因,在OSCC组织中低表达,并与患者临床分期、淋巴结转移、远处转移和生存状态有关,低表达lncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10∶1 OSCC患者有着较短的无进展生存时间和总生存时间.qRT-PCR验证结果与芯片结果相一致.结论 LncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10∶1有望成为成为OSCC早期诊断、治疗及预后评估的分子标志物.

作者:仇永乐;耿熙雪;刘远航;李昆珊;郭杰

来源:广东医学 2019 年 40卷 13期

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作者:
仇永乐;耿熙雪;刘远航;李昆珊;郭杰
来源:
广东医学 2019 年 40卷 13期
标签:
口腔鳞状细胞癌 长链非编码RNA 共表达网络 节点基因
目的 应用微阵列芯片技术检测长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)组织中的表达谱,筛选OSCC发病过程中节点lncRNA,研究其表达和临床意义.方法 利用lncRNA表达谱芯片,对3例OSCC及对应正常组织的转录本进行高通量筛查,确定OSCC中的lncRNAs和mRNAs差异表达谱.利用lncRNA与mRNA特异性表达的标准化信号强度,构建差异基因共表达网络,挖掘节点基因,分析其表达水平与临床病理特征及患者预后之间的关系.选取部分差异表达的lncRNA,借助qRT-PCR技术对芯片结果进行验证.结果 实验共筛选出差异表达lncRNAs2 294条和mRNAs 1 938条.LncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10∶1是共表达网络的节点基因,在OSCC组织中低表达,并与患者临床分期、淋巴结转移、远处转移和生存状态有关,低表达lncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10∶1 OSCC患者有着较短的无进展生存时间和总生存时间.qRT-PCR验证结果与芯片结果相一致.结论 LncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10∶1有望成为成为OSCC早期诊断、治疗及预后评估的分子标志物.