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目的 对2013—2020年期间从重庆市急性弛缓性麻痹病例(acute flaccid paralysis,AFP)中分离到的53株(non-polio enterovirus,NPEV)进行分型鉴定,了解NPEV型别分布特点.方法 使用商品化荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,real-time PCR)试剂对NPEV快速鉴定,结合VP1区和VP4区核苷酸序列特征进行分型.结果 鉴定出50株肠道病毒,A组33株(66.00%),B组17株(34.00%),不包含C、D组肠道病毒,3株不能分型.EV-A71为优势型别,11株(22.00%),2016年及以后未分离到EV-A71.研究中,VP4区和VP1区序列在NPEV分组上完全一致.结论 使用商品化荧光定量PCR试剂对肠道病毒分型时,高CT值的鉴定结果有可能不准确.NPEV分型中,先使用VP4区序列进行分组,然后在使用VP1区进行基因分型,可简化实验流程.重庆市AFP病例NPEV分离株的型别多样性较差,为丰富和完善重庆市肠道病毒基因数据库,有必要开展呼吸道传播的肠道病毒相关研究.

作者:彭靖尧;黄为;谢武娟;凌华;张敏;赵华

来源:公共卫生与预防医学 2022 年 33卷 4期

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作者:
彭靖尧;黄为;谢武娟;凌华;张敏;赵华
来源:
公共卫生与预防医学 2022 年 33卷 4期
标签:
急性弛缓性麻痹 非脊灰肠道病毒 VP1区 VP4区 基因分型
目的 对2013—2020年期间从重庆市急性弛缓性麻痹病例(acute flaccid paralysis,AFP)中分离到的53株(non-polio enterovirus,NPEV)进行分型鉴定,了解NPEV型别分布特点.方法 使用商品化荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,real-time PCR)试剂对NPEV快速鉴定,结合VP1区和VP4区核苷酸序列特征进行分型.结果 鉴定出50株肠道病毒,A组33株(66.00%),B组17株(34.00%),不包含C、D组肠道病毒,3株不能分型.EV-A71为优势型别,11株(22.00%),2016年及以后未分离到EV-A71.研究中,VP4区和VP1区序列在NPEV分组上完全一致.结论 使用商品化荧光定量PCR试剂对肠道病毒分型时,高CT值的鉴定结果有可能不准确.NPEV分型中,先使用VP4区序列进行分组,然后在使用VP1区进行基因分型,可简化实验流程.重庆市AFP病例NPEV分离株的型别多样性较差,为丰富和完善重庆市肠道病毒基因数据库,有必要开展呼吸道传播的肠道病毒相关研究.