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目的 研究深圳市福田区腹泻患者人星状病毒(human astrovirus,HAstV)感染的流行病学及分子特征.方法 收集2013年1月至2015年12月深圳市福田区1 625例疑似腹泻患者粪便标本,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-qPCR)方法检测粪便中的HAstV核酸,RT-qPCR阳性样品使用Mon269/Mon270引物对,用荧光逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HAstV的开放阅读框ORF2区域,将RT-PCR扩增产物纯化、测序后进行序列分析,并分析病例的流行病学资料.结果 2013-2015年福田区HAstV的检出率为2.03%(33/1 625),其中2013年的检出率为1.84%(12/653),2014年的检出率为1.31%(7/535),2015年的检出率为3.20%(14/437);男性检出率为2.27%(21/925),女性检出率为1.71%(12/700),男女患者检出率的差异无统计学意义(x2=0.62,P=0.431).HAstV在各年龄组人群均有检出,但在1岁以下年龄组患者的检出率最低,为1.69%(11/650).HAstV在1月份的检出率最高(5.59%,8/143),7月份的检出率最低(未检出).将33份RT-qPCR检测为HAstV阳性的样品用开放阅读框ORF2区进行分型,结果有27份可进一步分型,其中HAstV-1检出15株,是福田区HAstV的主要流行株,此外分别检出7株HAstV-4、4株HAstV-5和1株HAstV-2.结论 HAstV是导致福田区病毒性腹泻的病原体,HAstV-1是福

作者:张海龙;叶郁辉;杨洪;吴延杰;姚相杰;张振;陈龙;何雅青

来源:国际病毒学杂志 2018 年 25卷 1期

知识库介绍

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作者:
张海龙;叶郁辉;杨洪;吴延杰;姚相杰;张振;陈龙;何雅青
来源:
国际病毒学杂志 2018 年 25卷 1期
标签:
星状病毒 实时荧光定量逆转录聚合酶链反应 序列分析 流行病学研究 Astrovirus Reverse-transcriptase polymerase chain reaction Sequence analysis Epidemiologic studies
目的 研究深圳市福田区腹泻患者人星状病毒(human astrovirus,HAstV)感染的流行病学及分子特征.方法 收集2013年1月至2015年12月深圳市福田区1 625例疑似腹泻患者粪便标本,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-qPCR)方法检测粪便中的HAstV核酸,RT-qPCR阳性样品使用Mon269/Mon270引物对,用荧光逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HAstV的开放阅读框ORF2区域,将RT-PCR扩增产物纯化、测序后进行序列分析,并分析病例的流行病学资料.结果 2013-2015年福田区HAstV的检出率为2.03%(33/1 625),其中2013年的检出率为1.84%(12/653),2014年的检出率为1.31%(7/535),2015年的检出率为3.20%(14/437);男性检出率为2.27%(21/925),女性检出率为1.71%(12/700),男女患者检出率的差异无统计学意义(x2=0.62,P=0.431).HAstV在各年龄组人群均有检出,但在1岁以下年龄组患者的检出率最低,为1.69%(11/650).HAstV在1月份的检出率最高(5.59%,8/143),7月份的检出率最低(未检出).将33份RT-qPCR检测为HAstV阳性的样品用开放阅读框ORF2区进行分型,结果有27份可进一步分型,其中HAstV-1检出15株,是福田区HAstV的主要流行株,此外分别检出7株HAstV-4、4株HAstV-5和1株HAstV-2.结论 HAstV是导致福田区病毒性腹泻的病原体,HAstV-1是福