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目的:分析北京市境外输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组特征及变异情况。方法:2020年2—3月收集北京市来自5个国家的12例输入性新冠肺炎病例呼吸道标本,采用高通量测序法对病毒基因组测序,对序列进行比对和分析,并采用最大似然法构建系统发育树。结果:共获得12条长度为29 826~29 903 bp的SARS-CoV-2基因组序列,与Wuhan-Hu-1参考株的核苷酸和氨基酸序列一致性中位数分别为99.97

作者:李夫;潘阳;王雅杰;郭晶晶;曲梅;赵佳琛;李茂中;周珊珊;张代涛;陈丽娟;杨鹏;王全意

来源:国际病毒学杂志 2020 年 27卷 3期

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作者:
李夫;潘阳;王雅杰;郭晶晶;曲梅;赵佳琛;李茂中;周珊珊;张代涛;陈丽娟;杨鹏;王全意
来源:
国际病毒学杂志 2020 年 27卷 3期
标签:
新型冠状病毒 基因组 系统发育分析 变异 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Genome Phylogenetic analysis Variation
目的:分析北京市境外输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组特征及变异情况。方法:2020年2—3月收集北京市来自5个国家的12例输入性新冠肺炎病例呼吸道标本,采用高通量测序法对病毒基因组测序,对序列进行比对和分析,并采用最大似然法构建系统发育树。结果:共获得12条长度为29 826~29 903 bp的SARS-CoV-2基因组序列,与Wuhan-Hu-1参考株的核苷酸和氨基酸序列一致性中位数分别为99.97