目的:基于高通量测序技术对2022年1月至2022年10月扬州市4例境外输入新冠肺炎病例的咽拭子标本进行全基因组分析,了解其序列变异情况,为后续防控策略的调整提供科学依据。方法:利用Illumina iseq100和Oxford nanopore平台对扬州市4例境外输入新冠肺炎病例的咽拭子标本分别进行二代及三代高通量测序,获取全基因组序列,分析病毒变异位点与谱系型别。结果:基于二代测序平台,4例输入性病例序列长度为29 758 bp~29 861 bp,全基因组覆盖度为99.46
作者:李鑫娜;黄瑶;俞万钧;周乐;王艳;徐勤
来源:国际病毒学杂志 2023 年 30卷 4期