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目的 对新近建立的乙肝研究动物模型喜马拉雅旱獭3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)的部分cDNA序列进行了克隆和序列分析,为该模型在HBV感染研究中的应用奠定基础.方法 根据Genbank的人GAPDH cDNA的序列设计特异性引物,以提取的旱獭脾组织总RNA为模板,RT-PCR扩增旱獭GAPDHcDNA序列.纯化的PCR产物连接至T载体(pMD 18-T),然后构建重组质粒pMD18-T-mhGAPDH.对重组质粒进行PCR初筛、酶切鉴定,将阳性克隆测序.对序列进行同源性以及种系进化分析.结果 扩增的旱獭GAPDH序列为535 bp,编码序列为533 bp (nt3-535),编码177个氨基酸.获得的序列和其它类哺乳动物GAPDH的同源性均在88%以上,其中与土拨鼠GAPDH的同源性最高(99.62%),氨基酸序列同源性高达100%.构建种系进化树,分析结果提示喜马拉雅旱獭GAPDH与土拨鼠GAPDH的亲缘关系最接近.结论 成功的克隆了喜马拉雅旱獭GAPDH的部分序列.序列分析结果提示喜马拉雅旱獭GAPDH与土拨鼠GAPDH的亲缘关系最近,同源性最高.

作者:朱彬;王宝菊;朱珍妮;黄顺梅;宋志韬;李安意;陶元清;王忠东;陆蒙吉

来源:医学分子生物学杂志 2014 年 11卷 2期

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作者:
朱彬;王宝菊;朱珍妮;黄顺梅;宋志韬;李安意;陶元清;王忠东;陆蒙吉
来源:
医学分子生物学杂志 2014 年 11卷 2期
标签:
喜马拉雅旱獭 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 乙型乙肝病毒 动物模型 M.himalayana glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase hepatitis B virus animal model
目的 对新近建立的乙肝研究动物模型喜马拉雅旱獭3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)的部分cDNA序列进行了克隆和序列分析,为该模型在HBV感染研究中的应用奠定基础.方法 根据Genbank的人GAPDH cDNA的序列设计特异性引物,以提取的旱獭脾组织总RNA为模板,RT-PCR扩增旱獭GAPDHcDNA序列.纯化的PCR产物连接至T载体(pMD 18-T),然后构建重组质粒pMD18-T-mhGAPDH.对重组质粒进行PCR初筛、酶切鉴定,将阳性克隆测序.对序列进行同源性以及种系进化分析.结果 扩增的旱獭GAPDH序列为535 bp,编码序列为533 bp (nt3-535),编码177个氨基酸.获得的序列和其它类哺乳动物GAPDH的同源性均在88%以上,其中与土拨鼠GAPDH的同源性最高(99.62%),氨基酸序列同源性高达100%.构建种系进化树,分析结果提示喜马拉雅旱獭GAPDH与土拨鼠GAPDH的亲缘关系最接近.结论 成功的克隆了喜马拉雅旱獭GAPDH的部分序列.序列分析结果提示喜马拉雅旱獭GAPDH与土拨鼠GAPDH的亲缘关系最近,同源性最高.