目的 利用生物信息学分析技术筛选和鉴定参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因,并评价其在HCC发展及预后中的潜在价值.方法 从GEO数据库筛选出HCC基因数据集GSE101685、GSE84402和GSE46408,利用GEO2R对差异表达基因(DEGs)进行分析.采用DAVID数据库构建基因功能注释和通路富集分析.利用STRING数据库构建蛋白质互作网络(PPI)图,并用Cytoscape进行可视化分析,筛选出关键模块并获得核心基因.使用cBioPortal数据库进行生存分析.通过ONCOMINE数据库分析核心基因与HCC进展的关系.结果 在3个基因数据集中共筛选到261个DEGs,其中上调基因124个,下调基因137个.KEGG分析结果表明,DEGs主要参与细胞周期、DNA复制、视黄醇代谢等通路.PPI分析鉴定出10个核心基因,其中OIP5、HGFAC、FLVCR1与HCC分级、卫星结节和血管浸润有关,FLVCR1与患者生存情况有关.结论 该研究成功筛选出与HCC相关的DEGs和核心基因,其中OIP5、HGFAC、FLVCR1有望成为HCC诊疗和预后的生物标志物.
作者：刘娇阳；邓成敏；刘铁；李永文；罗娟；吴凯峰
来源：国际检验医学杂志 2022 年 43卷 3期
