目的:通过癌症基因谱(TCGA)数据库肾透明细胞癌(ccRCC)数据挖掘构建内源竞争RNA(ceRNA)网络,并探讨ceRNA网络在ccRCC中的作用机制。方法:首先在TCGA数据库中下载ccRCC 611例RNA-Seq测序数据和616例miRNA-Seq测序数据,筛选出肿瘤组织和正常肾组织差异表达lncRNA、miRNA和mRNA,利用差异表达RNA构建ccRCC lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络,并对网络中的差异表达RNA进行生存分析。结果:在差异表达ccRCC RNA中发现83种lncRNA与miRNA相关,其中34种与ccRCC的生存期相关;调控网络中miRNA 9种,其中2种miRNA与ccRCC生存期相关;调控网络中靶基因mRNA 17种,其中6种与ccRCC生存期相关。通过构建ceRNA调控网络和2种与ccRCC的生存期相关的miRNA为关键结点的子网络,将子网络中所有RNA进行生存分析发现38种RNA中有22种RNA(57.9
作者:管波;单卫民;李明;杜永强
来源:国际泌尿系统杂志 2021 年 41卷 5期