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目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨人参、茯苓、白术治疗溃疡性结肠炎的药理作用及分子机制。方法:检索TCMSP获取人参、茯苓、白术的活性成分,应用SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点;通过OMIM、DrugBank、TTD、PharmGKB、GeneCards数据库获取溃疡性结肠炎相关靶点;利用Draw Venn Diagram网站绘制药物与疾病交集靶点韦恩图;采用Cytoscape 3.8.2绘制“药物-成分-靶点”网络,并分析网络中关联度较高的靶点及药物活性成分;采用STRING数据库构建交集靶点PPI网络,应用Cytoscape 3.8.2中的NetworkAnalyzer插件对网络进行拓扑结构分析并筛选核心靶点;利用Metascape进行GO功能及KEGG通路富集分析;使用pyrx软件的vina进行分子对接验证。结果:筛选人参、茯苓、白术药物活性成分14个,核心成分为山柰酚、豆甾醇、蛇床子素、α-香树脂醇;药物靶点148个,疾病靶点1 307个,药物与疾病交集靶点50个,获得核心靶点23个,分别为ESR1、PTPN2、PIK3R1、SRC、EGFR、AKT1等。GO功能富集分析结果显示,靶点主要分布于细胞膜区,参与调节单加氧酶、氧化还原酶活性等生物功能,对激素、脂质等也具有调控作用。KEGG通路富集分析结果显示,主要富集通路为PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路和MAPK信号通路

作者:刘俊岑;王文娟;巴寅颖;迟莉;王佳佳

来源:国际中医中药杂志 2023 年 45卷 11期

知识库介绍

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作者:
刘俊岑;王文娟;巴寅颖;迟莉;王佳佳
来源:
国际中医中药杂志 2023 年 45卷 11期
标签:
人参 茯苓(中药) 白术 结肠炎,溃疡性 网络药理学 分子对接模拟 Ginseng Radix et Rhizoma Poria (TCD) Atractmlodis Macrocephalae Rhizoma Colitis, ulcerative Network pharmacology Molecular docking simulation
目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨人参、茯苓、白术治疗溃疡性结肠炎的药理作用及分子机制。方法:检索TCMSP获取人参、茯苓、白术的活性成分,应用SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点;通过OMIM、DrugBank、TTD、PharmGKB、GeneCards数据库获取溃疡性结肠炎相关靶点;利用Draw Venn Diagram网站绘制药物与疾病交集靶点韦恩图;采用Cytoscape 3.8.2绘制“药物-成分-靶点”网络,并分析网络中关联度较高的靶点及药物活性成分;采用STRING数据库构建交集靶点PPI网络,应用Cytoscape 3.8.2中的NetworkAnalyzer插件对网络进行拓扑结构分析并筛选核心靶点;利用Metascape进行GO功能及KEGG通路富集分析;使用pyrx软件的vina进行分子对接验证。结果:筛选人参、茯苓、白术药物活性成分14个,核心成分为山柰酚、豆甾醇、蛇床子素、α-香树脂醇;药物靶点148个,疾病靶点1 307个,药物与疾病交集靶点50个,获得核心靶点23个,分别为ESR1、PTPN2、PIK3R1、SRC、EGFR、AKT1等。GO功能富集分析结果显示,靶点主要分布于细胞膜区,参与调节单加氧酶、氧化还原酶活性等生物功能,对激素、脂质等也具有调控作用。KEGG通路富集分析结果显示,主要富集通路为PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路和MAPK信号通路