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目的:探索跨膜丝氨酸蛋白酶11B(TMPRSS11B)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中表达变化和其临床意义.方法:采取癌症基因组图谱(TCGA)数据库,分析TMPRSS 11B在OSCC中的转录水平及其与OSCC生存率的关系和对OSCC的诊断价值.通过GeneMANIA数据库预测TMPRSS 11B的互作基因,通过DAVID数据库对TMPRSS 11B及其互作基因进行GO和KEGG功能富集分析.采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测TMPRSS 11B在口腔癌细胞的转录水平,采用免疫组织化学染色(IHC)分析TMPRSS 11B在口腔癌组织中的蛋白表达水平,及其与OSCC临床病理指标的相关程度.结果:分析TCGA数据得知,TMPRSS11B在OSCC中mRNA水平显著低于正常口腔组织(P<0.05),且TMPRSS 11B低表达组生存率低于TM-PRSS11B高表达组(P<0.05).基于TCGA数据,作出受试者工作特征曲线(ROC),其曲线下面积(AUC)为0.793 (95% CI:0.697~0.889,P<0.05).GeneMANIA分析显示,TMPRSS11B与TMPRSS11E、KIF9和TMPRSS11D等为互作基因.GO分析示,TMPRSS11B及互作基因富集在角化细胞分化和角化作用等方面.KEGG通路分析表明,TMPRSS11B及互作基因可能涉及代谢途径和花生四烯酸代谢等分子机制.RT-qPCR结果显示,较于正常口腔细胞,在OSCC细胞中TMPRSS11B mRNA水平下调(P<0.05).IHC结果表明,较于配对癌旁正

作者:李丹苹;莫颖禧;吴姝;韩培培;李丽媚;赵军;张海山;李萍

来源:广西医科大学学报 2021 年 38卷 11期

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作者:
李丹苹;莫颖禧;吴姝;韩培培;李丽媚;赵军;张海山;李萍
来源:
广西医科大学学报 2021 年 38卷 11期
标签:
口腔鳞状细胞癌;TMPRSS11B;生物标志物
目的:探索跨膜丝氨酸蛋白酶11B(TMPRSS11B)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中表达变化和其临床意义.方法:采取癌症基因组图谱(TCGA)数据库,分析TMPRSS 11B在OSCC中的转录水平及其与OSCC生存率的关系和对OSCC的诊断价值.通过GeneMANIA数据库预测TMPRSS 11B的互作基因,通过DAVID数据库对TMPRSS 11B及其互作基因进行GO和KEGG功能富集分析.采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测TMPRSS 11B在口腔癌细胞的转录水平,采用免疫组织化学染色(IHC)分析TMPRSS 11B在口腔癌组织中的蛋白表达水平,及其与OSCC临床病理指标的相关程度.结果:分析TCGA数据得知,TMPRSS11B在OSCC中mRNA水平显著低于正常口腔组织(P<0.05),且TMPRSS 11B低表达组生存率低于TM-PRSS11B高表达组(P<0.05).基于TCGA数据,作出受试者工作特征曲线(ROC),其曲线下面积(AUC)为0.793 (95% CI:0.697~0.889,P<0.05).GeneMANIA分析显示,TMPRSS11B与TMPRSS11E、KIF9和TMPRSS11D等为互作基因.GO分析示,TMPRSS11B及互作基因富集在角化细胞分化和角化作用等方面.KEGG通路分析表明,TMPRSS11B及互作基因可能涉及代谢途径和花生四烯酸代谢等分子机制.RT-qPCR结果显示,较于正常口腔细胞,在OSCC细胞中TMPRSS11B mRNA水平下调(P<0.05).IHC结果表明,较于配对癌旁正