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目的:研究脂质代谢相关基因在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的表达,探讨脂质代谢关键基因在COPD中的可能机制.方法:从GEO和GeneCards数据库中获取数据,通过GO富集和PPI网络分析,筛选出差异表达的脂质代谢基因.香烟暴露24W建立肺气肿小鼠模型,HE染色观察小鼠肺组织病理学改变;使用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测小鼠肺组织中脂质代谢关键基因的mRNA相对表达水平;用香烟烟雾提取物干预正常人来源的肺上皮细胞系BEAS-2B,通过细胞增殖实验(CCK-8)法测定香烟烟雾提取物干预浓度,RT-qPCR测定BEAS-2B细胞中脂质代谢关键基因的相对表达量.结果:基于GEO和GeneCards数据库,筛选出5个脂质代谢关键基因(PIK3CA、PRKAG2、GNB3、PLCB2、GLA),发现PIK3CA和PRK4G2基因在吸烟相关COPD中的小气道上皮细胞中高表达,而GNB3、PLCB2和GLA基因的表达下调.成功构建的肺气肿小鼠模型,与野生型对照组比较,小鼠肺组织中PIK3CA和PRKAG2基因的mRNA表达增加(P<0.001),而GNB3、PLCB2和GLA基因的mRNA表达下调(P<0.001),与香烟烟雾提取物干预的BEAS-2B细胞中基因表达情况一致.结论:脂质代谢关键基因PIK3CA、PRKAG2、GNB3、PLCB2、GLA参与了 COPD的发生发展,可能是识别吸烟相关COPD的潜在生物标志物.

作者:梁彩霞;周广;周舟;钟小宁;梁毅

来源:广西医科大学学报 2023 年 40卷 2期

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作者:
梁彩霞;周广;周舟;钟小宁;梁毅
来源:
广西医科大学学报 2023 年 40卷 2期
标签:
COPD 脂质代谢相关基因 香烟烟雾 生物信息学
目的:研究脂质代谢相关基因在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的表达,探讨脂质代谢关键基因在COPD中的可能机制.方法:从GEO和GeneCards数据库中获取数据,通过GO富集和PPI网络分析,筛选出差异表达的脂质代谢基因.香烟暴露24W建立肺气肿小鼠模型,HE染色观察小鼠肺组织病理学改变;使用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测小鼠肺组织中脂质代谢关键基因的mRNA相对表达水平;用香烟烟雾提取物干预正常人来源的肺上皮细胞系BEAS-2B,通过细胞增殖实验(CCK-8)法测定香烟烟雾提取物干预浓度,RT-qPCR测定BEAS-2B细胞中脂质代谢关键基因的相对表达量.结果:基于GEO和GeneCards数据库,筛选出5个脂质代谢关键基因(PIK3CA、PRKAG2、GNB3、PLCB2、GLA),发现PIK3CA和PRK4G2基因在吸烟相关COPD中的小气道上皮细胞中高表达,而GNB3、PLCB2和GLA基因的表达下调.成功构建的肺气肿小鼠模型,与野生型对照组比较,小鼠肺组织中PIK3CA和PRKAG2基因的mRNA表达增加(P<0.001),而GNB3、PLCB2和GLA基因的mRNA表达下调(P<0.001),与香烟烟雾提取物干预的BEAS-2B细胞中基因表达情况一致.结论:脂质代谢关键基因PIK3CA、PRKAG2、GNB3、PLCB2、GLA参与了 COPD的发生发展,可能是识别吸烟相关COPD的潜在生物标志物.