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目的 探讨缺氧相关长链非编码RNA(lncRNA)与乳腺癌患者预后的相关性及其在预测乳腺癌预后的风险中的价值.方法(1)从癌症基因组图谱数据库中获得981例乳腺癌患者的RNA转录组测序数据和临床数据.采用Spearman检验筛选与缺氧相关的lncRNA.依次采用批量单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归模型筛选和确定影响乳腺癌患者生存情况的缺氧相关lncRNA,并根据相关系数建立风险评分模型.(2)根据风险评分(中位值为1.27分)将乳腺癌患者分为高危组和低危组,比较两组患者的生存情况;并采用时间依赖性受试者工作特征(ROC)曲线评估风险评分预测乳腺癌患者预后的效能.(3)以风险评分和年龄及肿瘤分级、原发肿瘤-区域淋巴结-远处转移(TNM)分期等临床病理特征为自变量,采用单因素和多因素Cox回归模型分析乳腺癌患者预后的独立影响因素;利用获得的独立影响因素构建预测乳腺癌患者1年、3年、5年生存情况的Nomogram模型;应用ROC曲线评价并比较Nomogram模型与年龄及肿瘤分级、TNM分期等临床病理指标预测乳腺癌患者生存情况的效能.结果(1)12个缺氧相关lncRNA(TNFRSF14-AS1、AL606834.2、LINC01871、AL136368.1、SEMA3B-AS1、AL136531.1、BAIAP2-DT、AC061992.1和AC008105.3、Z68871.1、LINC01235和AC090198.1)与乳腺癌患者的预

作者:闫雷;杨洋

来源:广西医学 2021 年 43卷 22期

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作者:
闫雷;杨洋
来源:
广西医学 2021 年 43卷 22期
标签:
乳腺癌;缺氧;长链非编码RNA;癌症基因组图谱数据库;预后;预测
目的 探讨缺氧相关长链非编码RNA(lncRNA)与乳腺癌患者预后的相关性及其在预测乳腺癌预后的风险中的价值.方法(1)从癌症基因组图谱数据库中获得981例乳腺癌患者的RNA转录组测序数据和临床数据.采用Spearman检验筛选与缺氧相关的lncRNA.依次采用批量单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归模型筛选和确定影响乳腺癌患者生存情况的缺氧相关lncRNA,并根据相关系数建立风险评分模型.(2)根据风险评分(中位值为1.27分)将乳腺癌患者分为高危组和低危组,比较两组患者的生存情况;并采用时间依赖性受试者工作特征(ROC)曲线评估风险评分预测乳腺癌患者预后的效能.(3)以风险评分和年龄及肿瘤分级、原发肿瘤-区域淋巴结-远处转移(TNM)分期等临床病理特征为自变量,采用单因素和多因素Cox回归模型分析乳腺癌患者预后的独立影响因素;利用获得的独立影响因素构建预测乳腺癌患者1年、3年、5年生存情况的Nomogram模型;应用ROC曲线评价并比较Nomogram模型与年龄及肿瘤分级、TNM分期等临床病理指标预测乳腺癌患者生存情况的效能.结果(1)12个缺氧相关lncRNA(TNFRSF14-AS1、AL606834.2、LINC01871、AL136368.1、SEMA3B-AS1、AL136531.1、BAIAP2-DT、AC061992.1和AC008105.3、Z68871.1、LINC01235和AC090198.1)与乳腺癌患者的预