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苯丙氨酸解氢酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)基因家族参与苯丙烷类代谢过程,通过调控植物抗病次生物质的合成在植物抗逆反应中发挥重要作用.为明确谷子PAL基因家族在逆境胁迫下的表达规律,该研究利用生物信息学方法对谷子PAL基因家族进行鉴定和表达分析.结果表明:谷子具有11个PAL基因,在进化树中可分为3个亚家族,SiPAL7独自进化为一支.通过构建蛋白结构域发现PAL基因家族成员均含有保守的PAL结构域.启动子分析显示,PAL基因含有应答激素、逆境胁迫等多种因子的顺式作用元件,说明PAL基因广泛参与不同生物学调控过程.RT-qPCR结果显示,谷子PAL基因家族多为诱导型表达,不同光照条件下PAL基因表达量变化明显,不同基因具有不同响应模式,说明谷子PAL基因家族在参与光调节反应中发挥重要作用.谷子PAL基因高度保守,广泛响应不同非生物胁迫,具有表达特异性.该研究结果为揭示PAL基因家族在调节谷子抗性及胁迫应答过程中的作用提供了参考.

作者:孟亚轩;孙颖琦;赵心月;王凤霞;瓮巧云;刘颖慧

来源:广西植物 2022 年 42卷 9期

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作者:
孟亚轩;孙颖琦;赵心月;王凤霞;瓮巧云;刘颖慧
来源:
广西植物 2022 年 42卷 9期
标签:
谷子 PAL基因家族 生物信息学分析 蛋白结构 表达分析
苯丙氨酸解氢酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)基因家族参与苯丙烷类代谢过程,通过调控植物抗病次生物质的合成在植物抗逆反应中发挥重要作用.为明确谷子PAL基因家族在逆境胁迫下的表达规律,该研究利用生物信息学方法对谷子PAL基因家族进行鉴定和表达分析.结果表明:谷子具有11个PAL基因,在进化树中可分为3个亚家族,SiPAL7独自进化为一支.通过构建蛋白结构域发现PAL基因家族成员均含有保守的PAL结构域.启动子分析显示,PAL基因含有应答激素、逆境胁迫等多种因子的顺式作用元件,说明PAL基因广泛参与不同生物学调控过程.RT-qPCR结果显示,谷子PAL基因家族多为诱导型表达,不同光照条件下PAL基因表达量变化明显,不同基因具有不同响应模式,说明谷子PAL基因家族在参与光调节反应中发挥重要作用.谷子PAL基因高度保守,广泛响应不同非生物胁迫,具有表达特异性.该研究结果为揭示PAL基因家族在调节谷子抗性及胁迫应答过程中的作用提供了参考.