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目的:研究鲫抗病毒蛋白Viperin(CaViperin)的表达特征,分析其启动子区主要转录因子结合位点并验证启动子活性.方法:采用半定量PCR法检测鲫Viperin在紫外灭活和活GCRV病毒、Poly(I:C)、LPS、重组干扰素处理鲫CAB细胞后不同时间点在RNA水平的表达量;采用Genome walking法从鲫基因组中扩增出鲫Viperin启动子片段-1832/+23,采用pGL3 Basic荧光素酶报告基因系统对启动子活性进行分析;在NCBI中选代表性物种(从鱼类到哺乳类)Viperin启动子序列,分析其主要转录因子结合元件ISRE和GAS,预测其受上游信号调控的保守性.结果:分析了紫外灭活或活GCRV病毒、Poly(I:C)、LPS、重组干扰素刺激鲫CAB细胞后Viperin表达的时序特征;成功克隆鲫Viperin启动子片段并构建报告基因表达质粒;分析并证实鲫Viperin启动子活性;从进化角度预测分析了Viperin基因受上游信号调节的保守性.结论:除LPS外,灭活或活GCRV病毒、Poly(I:C)、重组干扰素皆能诱导鲫Viperin转录;Viperin启动子区富含IFN信号诱导元件ISRE和GAS,且在不同物种间相对保守,因此推测Viperin基因受IFN及其上游信号诱导经由相对保守的信号通路.

作者:王兵;黄伟康;宋萍萍;吴建伟

来源:贵阳医学院学报 2015 年 40卷 12期

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作者:
王兵;黄伟康;宋萍萍;吴建伟
来源:
贵阳医学院学报 2015 年 40卷 12期
标签:
鲫 Viperin 抗病毒蛋白 转录启动子 crucian carp Viperin antiviral protein transcription initiation site
目的:研究鲫抗病毒蛋白Viperin(CaViperin)的表达特征,分析其启动子区主要转录因子结合位点并验证启动子活性.方法:采用半定量PCR法检测鲫Viperin在紫外灭活和活GCRV病毒、Poly(I:C)、LPS、重组干扰素处理鲫CAB细胞后不同时间点在RNA水平的表达量;采用Genome walking法从鲫基因组中扩增出鲫Viperin启动子片段-1832/+23,采用pGL3 Basic荧光素酶报告基因系统对启动子活性进行分析;在NCBI中选代表性物种(从鱼类到哺乳类)Viperin启动子序列,分析其主要转录因子结合元件ISRE和GAS,预测其受上游信号调控的保守性.结果:分析了紫外灭活或活GCRV病毒、Poly(I:C)、LPS、重组干扰素刺激鲫CAB细胞后Viperin表达的时序特征;成功克隆鲫Viperin启动子片段并构建报告基因表达质粒;分析并证实鲫Viperin启动子活性;从进化角度预测分析了Viperin基因受上游信号调节的保守性.结论:除LPS外,灭活或活GCRV病毒、Poly(I:C)、重组干扰素皆能诱导鲫Viperin转录;Viperin启动子区富含IFN信号诱导元件ISRE和GAS,且在不同物种间相对保守,因此推测Viperin基因受IFN及其上游信号诱导经由相对保守的信号通路.