目的:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库及转录组数据分析组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在胃癌(GC)中的表达情况、探讨HDAC1与临床参数的关系,并预测其在肿瘤发生发展中的可能机制.方法:从TCGA数据库中下载GC组织(GC组,371例)和正常胃组织(正常组,36例)的RNASeq数据和临床信息,比较正常组与GC组HDAC1 mRNA的表达差异;将GC组分为HDAC1 mRNA高表达组(高于均值)271例和HDAC1 mRNA低表达组(低于均值)100例,分析GC患者HDAC1表达量与临床病理参数的相关性及其预后;利用LinkedOmics数据库分析与HDAC1表达相关的基因,Omicsbean-Canner预测HDAC1基因相关信号通路及功能富集.结果:GC组标本HDAC1基因平均表达量明显高于正常组(t=6.88,P<0.01);GC患者HDAC1基因表达与患者的年龄、T分期、AJCC分期及幽门螺杆菌(H.pylori)感染等病理参数呈正相关性(P<0.05),但与性别、N分期及M分期等病理参数无相关性(P>0.05);Kaplan-Meier分析结果表明,HDAC1基因表达与生存无相关性(P>0.05);GC组患者HADC1基因表达与AK2(adenylate kinase 2)、EIF3I(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I,)及MARCKSL1(MARCKS like 1)等9118个基因表达量呈正相关,与GNAL(G protein subunit alpha L)、ARMCX2(armadillo repeat containing X-l

作者：李抄；陈定宇；张晓怡；赵艳；王琴容；周建奖；鲍丽雅；谢渊

来源：贵州医科大学学报 2020 年 45卷 2期