目的 通过生物信息学方法筛选出非小细胞肺癌(NSCLC)和对应的癌旁组织细胞的差异表达基因,寻找可能参与肺癌发生的关键基因,并分析其中关键基因与肺癌预后的关系.方法 根据人类肿瘤相关的基因表达汇编(GEO)中NSCLC组织和癌旁组织的表达谱芯片数据,以LogFC(Fold Change)绝对值>1且P<0.01作为标准筛选差异表达基因;利用STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作者用(PPI)网络,筛选核心基因;选择核心基因中肺癌预后基因CAV1,利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库分析核心基因与NSCLC患者的关系;收集100例NSCLC患者分为NSCLC组和癌旁组织组,检测两组组织中小窝蛋白1(Caveolin1)的表达情况.结果 根据GEO数据,在NSCLC组织和癌旁组织间共筛选出256个差异基因,其中上调的基因有206个,下调的基因有50个;PPI筛选出14个关键基因,选择CAV1基因开展后续研究;TCGA数据分析显示,NSCLC肿瘤组织中高表达CAV1的肿瘤患者生存期短于低表达CAV1的肿瘤患者(P<0.05),NSCLC肿瘤组织中不同性别间CAV1基因表达量变化不明显(P>0.05),NSCLC肿瘤组织中CAV1表达量明显高于癌旁组织(P<0.01),CAV1与MKI67、VIM的表达呈正相关(R=0.15、R=0.29,P<0.05);NSCLC组中Caveolin1蛋白表达高于癌旁组织组(P<0.05).结论 CAV1基因表达与NSCLC患

作者：杨凯；杨明；苏学会；温辉；单娜

来源：贵州医科大学学报 2022 年 47卷 6期