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目的:基于网络药理学探讨四逆加人参汤治疗新冠肺炎的作用机制.方法:运用中医药系统药理数据库(TCMSP)平台查询四逆加人参汤中化合物成分,设置口服利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,得到有效化合物.将结果输入Uniprot数据库,统一转换为规范靶点名称.运用GeneCards和OMIM数据库查询COVID-19靶点,得到二者交集靶点,绘制Venn图.运用Cytoscape 3.7.2软件,绘制成分-疾病-靶点网络图.运用相互作用数据库平台String进行靶蛋白互作分析,将数据输入Cytoscape 3.7.2软件进行网络图绘制.运用DAVID数据库对药物-疾病交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.运用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点-通路网络图.结果:经筛选得到四逆加人参汤有效活性成分112个,对应234个靶点.经查询筛选得到COVID-19靶点261个,Venn图显示二者交集靶点50个.成分-疾病-靶点网络图中度值较高的化合物为槲皮素、山奈酚、柚皮素、β-谷甾醇.PPI网络分析度值较高的靶蛋白为白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、TP53、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶3(CASP3).GO富集功能分析显示涉及生物过程341个,细胞组分33个,分子功能50

作者:赵欣华;张东旭;赵恬静;庞雪莹;刘松江

来源:海南医学院学报 2021 年 27卷 19期

知识库介绍

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作者:
赵欣华;张东旭;赵恬静;庞雪莹;刘松江
来源:
海南医学院学报 2021 年 27卷 19期
标签:
网络药理学;新型冠状病毒肺炎;四逆加人参汤;作用机制
目的:基于网络药理学探讨四逆加人参汤治疗新冠肺炎的作用机制.方法:运用中医药系统药理数据库(TCMSP)平台查询四逆加人参汤中化合物成分,设置口服利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,得到有效化合物.将结果输入Uniprot数据库,统一转换为规范靶点名称.运用GeneCards和OMIM数据库查询COVID-19靶点,得到二者交集靶点,绘制Venn图.运用Cytoscape 3.7.2软件,绘制成分-疾病-靶点网络图.运用相互作用数据库平台String进行靶蛋白互作分析,将数据输入Cytoscape 3.7.2软件进行网络图绘制.运用DAVID数据库对药物-疾病交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.运用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点-通路网络图.结果:经筛选得到四逆加人参汤有效活性成分112个,对应234个靶点.经查询筛选得到COVID-19靶点261个,Venn图显示二者交集靶点50个.成分-疾病-靶点网络图中度值较高的化合物为槲皮素、山奈酚、柚皮素、β-谷甾醇.PPI网络分析度值较高的靶蛋白为白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、TP53、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶3(CASP3).GO富集功能分析显示涉及生物过程341个,细胞组分33个,分子功能50