目的 探讨通过PIL法和通路富集分析法,预测与宫颈癌相关的潜在mRNA及调控miRNA,证实相关分子调控通路的可靠性和有效性.方法 PIL法是以Borda选举算法为基础,将皮尔逊相关系数(PCC)、因果推理法(IDA)和回归法(Lasso)三者结合,形成的"PIL"综合分析方法.本研究首先分别采用PCC、IDA、Lasso三种方法筛选数据库中宫颈癌相关miRNA及负向调控靶基因.之后,将PIL法预测结果与miRNA数据库中已经试验证实的靶基因及其调控micro RNA(miRNA)的调控信息进行对比验证.最后,通过PIL法筛选出TCGA数据库内与宫颈癌发病最相关即相互作用最显著的1000个mRNA及调控miRNA,采用KEGG数据库进行信号转导通路富集分析,发现与宫颈癌最具有相关性的靶通路.结果 PIL法共获得10个预测频率>5次的靶基因,包括分泌型卷曲相关蛋白4(SFRP44),母系表达基因3(MEG3)和NIPA样结构域(NIPA 4).KEGG数据库从所有信号通路中共鉴定出17个与宫颈癌最具显著相关性的细胞因子-受体作用目标通路(P=8.91×10-7).结论 通过PIL综合分析法进行miR-NA数据库资料采集、靶基因筛选、信号通路分析可行、可靠.
作者：尉文功；陈锐
来源：哈尔滨医科大学学报 2019 年 53卷 6期
