目的 探究胰腺癌血清外泌体中环状RNA对于外周血单个核细胞(peripheral blood mononu-clear cell,PBMC)的调节机制及应用价值.方法 对基因芯片数据进行生物信息学分析,建立了在胰腺癌中的ceRNA网络,通过R语言、TargetScan以及Cytoscape等分析预测软件对GEO数据库中GSE100206、GSE100232、GSE37710、GSE49641的数据进行了分析和整合.利用GO功能分析以及Reac-tome pathway分析寻找相关基因的功能以及通路.利用cMap数据库,查找同时影响差异表达circRNA和差异表达mRNA的相关药物.结果 通过分析GSE100232以及GSE100206数据集,得到了 559个在胰腺癌血清外泌体中具有差异表达的circRNA.通过分子海绵吸附原则预测了 circRNA所对应的miR-NA,其结果与GSE37710数据集中差异表达的miRNA进行比对,选取二者交集得到76个miRNA.通过生物信息学分析预测与miRNA所对应的mRNA,其结果与GSE49641数据集中差异表达的mRNA交集得到4个mRNA,对其进行整合得到ceRNA网络.分析得到PBMC相关调控通路,以及可以作为药物靶点的差异基因.结论 本研究在胰腺癌患者的血液中发现了显著改变的circRNA、miRNA和mRNA,可作为治疗胰腺癌诊断及治疗的潜在靶点.阐明了胰腺癌ceRNA互作网络在PBMC中的可行性.PBMC中的宿主基因可作为药物调控的靶点,进行
作者:井庆旭;薛东波
来源:哈尔滨医科大学学报 2021 年 55卷 6期