目的:采用生物信息学方法分析、预测在原发性肝细胞癌(HCC)中差异表达的表达序列标签(EST)的结构与功能,指导实验研究.方法:应用Blastn、SequencherTM、ORF Finder和DNASIS等软件分析肝细胞癌中差异表达的EST的全长、开放读码框、电子表达谱、染色体定位和编码蛋白质的功能.结果:获得2条新的cDNA全长序列;2条EST分别定位于2p13～15、3p14;高表达EST主要表达于肿瘤组织,低表达EST主要表达于正常组织;高表达基因编码蛋白质参与细胞信号转导、前mRNA加工和细胞骨架组装,低表达基因编码蛋白质与机体T淋巴细胞介导的免疫反应有关.结论:生物信息学技术有助于高效、快速地克隆、鉴定新基因.
作者：陈香宇；段芳龄；李建生；朱武凌；韩泽广；薛乐勋
来源：郑州大学学报(医学版) 2004 年 39卷 2期
