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目的:了解2010年河南省流行的肠道病毒(EV)71型基因特征.方法:筛选2010年河南省分离的EV71型病毒株1株(EV71/Henan/DC/2010),进行全基因组序列测定和基因进化特性分析.结果:EV71/Henan/DC/2010与其他EV71病毒株相比,编码区无核苷酸的缺失或插入,5'UTR区和3'UTR区长度和序列有一定差异.核苷酸同源性比较显示,EV71/Henan/DC/2010与2008年北京暴发流行株同源性最高(99.2%),与安徽阜阳暴发流行株和河南省暴发流行株均具有很高的同源性(98.1%和99.1%);与EV71各亚型代表株的比较结果显示,除VP3区以外,EV71/Henan/DC/2010各区均与C4亚型代表株同源性最高;氨基酸同源性比较结果显示,EV71/Henan/DC/2010大多数核苷酸变异属无义突变,相应氨基酸并未随之发生改变.根据VP1区基因序列构建遗传进化分析树显示,EV71/Henan/DC/2010与C4亚型同属一个分支.结论:EV71/Henan/DC/2010与2008年北京EV71流行株亲缘关系最为接近,同属于C4亚型.与我省及我国既往流行毒株相比,未发生大的变异.

作者:李幸乐;许玉玲;黄学勇;陈豪敏;许汴利

来源:郑州大学学报(医学版) 2011 年 46卷 5期

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作者:
李幸乐;许玉玲;黄学勇;陈豪敏;许汴利
来源:
郑州大学学报(医学版) 2011 年 46卷 5期
标签:
手足口病 肠道病毒71型 测序 同源性分析
目的:了解2010年河南省流行的肠道病毒(EV)71型基因特征.方法:筛选2010年河南省分离的EV71型病毒株1株(EV71/Henan/DC/2010),进行全基因组序列测定和基因进化特性分析.结果:EV71/Henan/DC/2010与其他EV71病毒株相比,编码区无核苷酸的缺失或插入,5'UTR区和3'UTR区长度和序列有一定差异.核苷酸同源性比较显示,EV71/Henan/DC/2010与2008年北京暴发流行株同源性最高(99.2%),与安徽阜阳暴发流行株和河南省暴发流行株均具有很高的同源性(98.1%和99.1%);与EV71各亚型代表株的比较结果显示,除VP3区以外,EV71/Henan/DC/2010各区均与C4亚型代表株同源性最高;氨基酸同源性比较结果显示,EV71/Henan/DC/2010大多数核苷酸变异属无义突变,相应氨基酸并未随之发生改变.根据VP1区基因序列构建遗传进化分析树显示,EV71/Henan/DC/2010与C4亚型同属一个分支.结论:EV71/Henan/DC/2010与2008年北京EV71流行株亲缘关系最为接近,同属于C4亚型.与我省及我国既往流行毒株相比,未发生大的变异.