目的:采用网络药理学方法建立“药效成分-疾病靶标-生物学通路”之间的关系,筛选肉桂治疗慢性肾脏病的作用靶点,明确其作用机制.方法:采用中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)数据库获得肉桂的活性化合物,利用PubChem数据库,获取化合物的SMILES结构,将SMILES结构导入SwissTargetPrediction平台,预测活性成分的潜在靶点,再通过GeneCards数据库获得相关化合物靶点,取两者交集得到肉桂作用靶点.通过TTD、DrugBank、OMIM、GAD、DisGeNET数据库获得CKD疾病相关靶点,并与肉桂作用靶点取交集.利用STRING数据库及Cytoscape3.2.1软件构建靶点相互作用网络图,并利用cytoHubba插件的MCC算法筛选关键靶点;基于DAVID数据库对靶点进行GO富集和KEGG富集分析.结果:共得到肉桂活性化合物18个,肉桂-CKD交集靶点29个.经过MCC算法筛选得到关键基因10个,包括雌激素受体alpha、人环加氧酶1、表皮生长因子受体、血管内皮生长因子受体、基质金属蛋白酶9、基质金属蛋白酶2、成纤维细胞生长因子受体1、丝氨酸蛋白酶抑制剂-1、DNA多聚酶B、多药耐药性蛋白1、B细胞淋巴瘤/白血病-2.GO富集共118个结果,主要包括细胞对缺氧的反应、丝裂原活化蛋白激酶活性的正调节、血管生成的正调节、炎症反应、磷脂酶C活性的正调节、蛋白自体磷酸
作者:李若颀;夏天卫;陈晨;施乐;周国威;刘金柱;刘昱江;沈计荣
来源:中医学报 2020 年 35卷 6期