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目的:基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药百科全书数据库(encyclopedia of traditional chinese medicine,ETCM)检索四神煎组方中药的主要化学成分,并结合文献进行筛选、补充;通过Pubchem有机小分子生物活性数据库检索化学成分的SMILES结构式及2D结构,经Swiss ADME数据库筛选后将符合标准的化学成分上传至Swiss Target Prediction数据库预测药物活性靶点;通过人类基因数据库(Gencards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、治疗靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、DrugBank数据库获取RA疾病相关靶点;绘制韦恩图并获取四神煎活性成分与RA的共同靶点;基于String平台构建药物疾病共同靶点的蛋白互作网络;基于Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;采用Cytoscape 3.7.1软件构建"成分-靶点-通路"网络,应用网络分析仪(network analyzer)功能获得各成分、靶点的

作者:付静思;姜泉;夏聪敏;但文超;巩勋;岳铭;唐晓颇

来源:中医学报 2022 年 37卷 1期

知识库介绍

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作者:
付静思;姜泉;夏聪敏;但文超;巩勋;岳铭;唐晓颇
来源:
中医学报 2022 年 37卷 1期
标签:
四神煎;类风湿关节炎;网络药理学;作用机制
目的:基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药百科全书数据库(encyclopedia of traditional chinese medicine,ETCM)检索四神煎组方中药的主要化学成分,并结合文献进行筛选、补充;通过Pubchem有机小分子生物活性数据库检索化学成分的SMILES结构式及2D结构,经Swiss ADME数据库筛选后将符合标准的化学成分上传至Swiss Target Prediction数据库预测药物活性靶点;通过人类基因数据库(Gencards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、治疗靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、DrugBank数据库获取RA疾病相关靶点;绘制韦恩图并获取四神煎活性成分与RA的共同靶点;基于String平台构建药物疾病共同靶点的蛋白互作网络;基于Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;采用Cytoscape 3.7.1软件构建"成分-靶点-通路"网络,应用网络分析仪(network analyzer)功能获得各成分、靶点的